MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2915892428 · doi:10.1038/s41598-019-38490-1

Elevated ubiquitinated proteins in brain and blood of individuals with schizophrenia

2019· article· en· W2915892428 sur OpenAlexaff
Chad Bousman, Sandra Luza, Serafino G. Mancuso, Dali Kang, Carlos Opazo, Md Shaki Mostaid, Vanessa Cropley, Patrick D. McGorry, Cynthia Shannon Weickert, Christos Pantelis, Ashley I. Bush, Ian Everall

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensHotchkiss Brain InstituteAlberta Children's HospitalUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismNational Health and Medical Research CouncilNational Institutes of HealthUniversity of SydneyRamsay Health CareAustralian Schizophrenia Research BankSylvia and Charles Viertel Charitable FoundationAustralian GovernmentMurdoch Children's Research InstitutePratt FoundationMedical Research CouncilChildren’s Hospital of Wisconsin Research Institute
Mots-clésSchizophrenia (object-oriented programming)UbiquitinProteasomePathogenesisMedicineInternal medicinePsychiatryBiologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dysregulation of the ubiquitin proteasome system (UPS) has been linked to schizophrenia but it is not clear if this dysregulation is detectable in both brain and blood. We examined free mono-ubiquitin, ubiquitinated proteins, catalytic ubiquitination, and proteasome activities in frozen postmortem OFC tissue from 76 (38 schizophrenia, 38 control) matched individuals, as well as erythrocytes from 181 living participants, who comprised 30 individuals with recent onset schizophrenia (mean illness duration = 1 year), 63 individuals with 'treatment-resistant' schizophrenia (mean illness duration = 17 years), and 88 age-matched participants without major psychiatric illness. Ubiquitinated protein levels were elevated in postmortem OFC in schizophrenia compared to controls (p = <0.001, AUC = 74.2%). Similarly, individuals with 'treatment-resistant' schizophrenia had higher levels of ubiquitinated proteins in erythrocytes compared to those with recent onset schizophrenia (p < 0.001, AUC = 65.5%) and controls (p < 0.001, AUC = 69.4%). The results could not be better explained by changes in proteasome activity, demographic, medication, or tissue factors. Our results suggest that ubiquitinated protein formation may be abnormal in both the brain and erythrocytes of those with schizophrenia, particularly in the later stages or specific sub-groups of the illness. A derangement in protein ubiquitination may be linked to pathogenesis or neurotoxicity in schizophrenia, and its manifestation in the blood may have prognostic utility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueScientific ReportsMême sujetUbiquitin and proteasome pathwaysTravaux en français237 207