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Enregistrement W2918517022 · doi:10.1016/j.ajhg.2019.01.010

Missense Variants in the Histone Acetyltransferase Complex Component Gene TRRAP Cause Autism and Syndromic Intellectual Disability

2019· article· en· W2918517022 sur OpenAlexafffund
Benjamin Cogné, Sophie Ehresmann, Éliane Beauregard‐Lacroix, Justine Rousseau, Thomas Besnard, Thomas X. Garcia, Slavé Petrovski, Shiri Avni, Kirsty McWalter, Patrick R. Blackburn, Stephan Sanders, Kévin Uguen, Jacqueline Harris, Julie S. Cohen, Moira Blyth, Anna Lehman, Jonathan Berg, Mindy Li, Usha Kini, Shelagh Joss, Charlotte von der Lippe, Christopher T. Gordon, Jennifer B. Humberson, Laurie Robak, Daryl A. Scott, V. Reid Sutton, Cara Skraban, Jennifer J. Johnston, Annapurna Poduri, Magnus Nordenskjöld, Vandana Shashi, Erica H. Gerkes, Ernie M.H.F. Bongers, Christian Gilissen, Yuri A. Zárate, Malin Kvarnung, Kevin P. Lally, Peggy Kulch, Brina Daniels, Andrés Hernández, Nicholas Stong, Julie McGaughran, Kyle Retterer, Kristian Tveten, Jennifer A. Sullivan, Madeleine R. Geisheker, Asbjørg Stray‐Pedersen, Jennifer Tarpinian, Eric W. Klee, Julie C. Sapp, Jacob Zyskind, Øystein L. Holla, Emma Bedoukian, Francesca Filippini, Anne Guimier, Arnaud Picard, Øyvind L. Busk, Jaya Punetha, Rolph Pfundt, Anna Lindstrand, Ann Nordgren, Fayth M. Kalb, Megha Desai, Ashley H. Ebanks, Shalini N. Jhangiani, Tammie Dewan, Zeynep Coban‐Akdemir, Aida Telegrafi, Elaine H. Zackai, Amber Begtrup, Xiaofei Song, Annick Toutain, Ingrid M. Wentzensen, Sylvie Odent, Dominique Bonneau, Xénia Latypova, Wallid Deb, Sylvia Redon, Frédéric Bilan, Marine Legendre, Caitlin Troyer, Kerri Whitlock, Oana Caluseriu, Marine I. Murphree, Pavel N. Pichurin, Katherine Agre, Ralitza H. Gavrilova, Tuula Rinne, Meredith Park, Catherine Shain, Erin L. Heinzen, Rui Xiao, Jeanne Amiel, Stanislas Lyonnet, Bertrand Isidor, Leslie G. Biesecker, Dan Lowenstein, Jennifer E. Posey, Anne‐Sophie Denommé‐Pichon, Claude Férec, Xiang‐Jiao Yang, Jill A. Rosenfeld, Brigitte Gilbert‐Dussardier, Séverine Audebert‐Bellanger, Richard Redon, Holly A.F. Stessman, Christoffer Nellåker, Yaping Yang, James R. Lupski, David B. Goldstein, Evan E. Eichler, François V. Bolduc, Stéphane Bezieau, Sébastien Küry, Philippe M. Campeau

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Human Genetics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensWomen and Children’s Health Research InstituteMcGill UniversityUniversity of British ColumbiaMcGill University Health CentreUniversity of AlbertaUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research InstituteNational Institute of Mental HealthNational Heart, Lung, and Blood InstituteCanadian Institutes of Health ResearchCenter for Individualized Medicine, Mayo ClinicNational Institutes of HealthGénome QuébecGenome British ColumbiaChildren's Hospital FoundationBaylor-Hopkins Center for Mendelian GenomicsKids Brain Health NetworkFonds de Recherche du Québec - SantéBC Children's HospitalBC Children’s Hospital FoundationMcGill UniversityMinistère des Affaires Sociales et de la SantéJohns Hopkins UniversityMedical Research CouncilMayo Clinic
Mots-clésGeneticsBiologyMissense mutationIntellectual disabilityPhenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations55
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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