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Enregistrement W2918792618 · doi:10.3390/ijms20051116

Regulatory Effect of DNA Topoisomerase I on T3SS Activity, Antibiotic Susceptibility and Quorum- Sensing-Independent Pyocyanin Synthesis in Pseudomonas aeruginosa

2019· article· en· W2918792618 sur OpenAlexafffund
Yan Rong, Shikun Hu, Ning Ma, Peiqing Song, Qingqing Liang, Huiqun Zhang, Yanqi Li, Lixin Shen, Kangmin Duan, Lin Chen

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAntibiotic Resistance in Bacteria
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Shaanxi Provincial Department of EducationChangjiang Scholar Program of Chinese Ministry of EducationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNatural Science Foundation of Shaanxi ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPyocyaninPseudomonas aeruginosaQuorum sensingMutantDNA supercoilTopoisomeraseBiologyBiofilmDNAMicrobiologyGeneDNA replicationBacteriaBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Topoisomerases are required for alleviating supercoiling of DNA during transcription and replication. Recent evidence suggests that supercoiling of bacterial DNA can affect bacterial pathogenicity. To understand the potential regulatory role of a topoisomerase I (TopA) in Pseudomonas aeruginosa, we investigated a previously isolated topA mutation using genetic approaches. We here report the effects of the altered topoisomerase in P. aeruginosa on type III secretion system, antibiotic susceptibility, biofilm initiation, and pyocyanin production. We found that topA was essential in P. aeruginosa, but a transposon mutant lacking the 13 amino acid residues at the C-terminal of the TopA and a mutant, named topA-RM, in which topA was split into three fragments were viable. The reduced T3SS expression in topA-RM seemed to be directly related to TopA functionality, but not to DNA supercoiling. The drastically increased pyocyanin production in the mutant was a result of up-regulation of the pyocyanin related genes, and the regulation was mediated through the transcriptional regulator PrtN, which is known to regulate bacteriocin. The well-established regulatory pathway, quorum sensing, was unexpectedly not involved in the increased pyocyanin synthesis. Our results demonstrated the unique roles of TopA in T3SS activity, antibiotic susceptibility, initial biofilm formation, and secondary metabolite production, and revealed previously unknown regulatory pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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