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Enregistrement W2919332642

Application of SMILES strings to identification of functional groups responsible for biological activity in medicinal compounds

2018· article· en· W2919332642 sur OpenAlex
Sholeh Maslehat, Soroush Sardari, Mehdi Soheilizad, Payman Nickchi

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueAmazonia Investiga · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFunctional groupIdentification (biology)Biological activityComputer scienceBiologyChemistryEcologyGenetics
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An efficient and practical approach to identification of important functional groups in the structure of medicinal molecules that are main factor to create biological activity by use of SMILES line notation system is described. Simplicity, high proficiency and fast timing are the main of current method. In this study we aim to find an association between some of the identified functional groups, using SMILES code and their corresponding biological properties in the Canada Drug database. In this study, each functional group and its category which has been tested is presented in the corresponding number of occurrences in the category and the total number is shown as well. The p-value for each functional group – category is calculated using proportion test and R statistical software. The tabular results, the last column indicates the impact of our hypothesis for example, sulfonylurea and 5-thio-1H-tetrazole functional groups are associated with their corresponding category and are significant at 0.05 level. Penicillin and 3-aminopropane-1,2-diol are also significant in the majority of their categories. we have developed a  method to create a logical and robust relationship between functional groups and biological activity of molecules. According to existing protocol, finding functional groups responsible for the biological activity of medicinal or chemical compounds is possible. Biological Activity, Functional Group, Medicine, SMILES.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,597
Score d'incertitude au seuil0,393

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle