MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2919355321 · doi:10.1101/569301

Genetic Polymorphisms and Molecular Mechanisms Mediating Oncolytic Potency of Reovirus Strains

2019· preprint· en· W2919355321 sur OpenAlexaff
Adil Mohamed, Derek R. Clements, Prathyusha Konda, Shashi Gujar, Patrick W. Lee, James R. Smiley, Maya Shmulevitz

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensIzaak Walton Killam Health CentreDalhousie UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOncolytic virusBiologyViral replicationVirologyVirusPhenotypeGenePotencyCell cultureIn vitroGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The Dearing strain of Mammalian orthoreovirus (T3D) is undergoing clinical trials as an oncolytic virotherapeutic agent. In this study, a comprehensive phenotypic and genetic comparison of T3D virus stocks from various laboratories and commercial sources revealed that T3D laboratory strains differ substantially in their oncolytic activities in vitro and in vivo . Superior replication of the most-oncolytic T3D lab strain was attributed to several mechanistic advantages: virus-cell binding, viral RNA transcriptase activity, viral inclusion morphology, and differential activation of RIG-I versus NFκB-dependent signalling pathways. Viral S4, M1 and L3 gene segments were each independently associated with a distinct mechanistic advantage. Furthermore, the specific missense polymorphisms that governed replication potency were identified, and utilized to generate a hybrid of T3D laboratory strains with further-augmented replication in tumor cells. Together, the results depict an elaborate balance between reovirus replication and host-cell signaling to achieve optimal oncolytic reovirus efficacy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetVirus-based gene therapy research→Travaux en français237 207→