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Enregistrement W2920624653 · doi:10.1016/j.celrep.2019.02.026

FMR1 Reactivating Treatments in Fragile X iPSC-Derived Neural Progenitors In Vitro and In Vivo

2019· article· en· W2920624653 sur OpenAlexfundno aff
Dan Vershkov, Nina Fainstein, Sapir Suissa, Tamar Golan‐Lev, Tamir Ben‐Hur, Nissim Benvenisty

Notice bibliographique

RevueCell Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAzrieli FoundationTeva Pharmaceutical Industries
Mots-clésFMR1ChromatinBiologyChromosomal fragile siteFragile X syndromeGene silencingCell biologyInduced pluripotent stem cellGeneticsGeneEmbryonic stem cellFragile x

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fragile X syndrome (FXS) is caused primarily by a CGG repeat expansion in the FMR1 gene that triggers its transcriptional silencing. In order to investigate the regulatory layers involved in FMR1 inactivation, we tested a collection of chromatin modulators for the ability to reactivate the FMR1 locus. Although inhibitors of DNA methyltransferase (DNMT) induced the highest levels of FMR1 expression, a combination of a DNMT inhibitor and another compound potentiated the effect of reactivating treatment. To better assess the rescue effect following direct demethylation, we characterized the long-term and genome-wide effects of FMR1 reactivation and established an in vivo system to analyze FMR1-reactivating therapies. Systemic treatment with a DNMT inhibitor in mice carrying FXS induced pluripotent stem cell (iPSC)-derived transplants robustly induced FMR1 expression in the affected tissue, which was maintained for a prolonged period of time. Finally, we show a proof of principle for FMR1-reactivating therapy in the context of the CNS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,537

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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