The development and prevalidation of an<i>in vitro</i>mutagenicity assay based on MutaMouse primary hepatocytes, Part II: Assay performance for the identification of mutagenic chemicals
Notice bibliographique
Résumé
As demonstrated in Part I, cultured MutaMouse primary hepatocytes (PHs) are suitable cells for use in anin vitrogene mutation assay due to their metabolic competence, their “normal” phenotype, and the presence of the MutaMouse transgene for reliable mutation scoring. The performance of these cells in anin vitrogene mutation assay is evaluated in this study, Part II. A panel of 13 mutagenic and nonmutagenic compounds was selected to investigate the performance of the MutaMouse PHin vitrogene mutation assay. The nine mutagens represent a range of classes of chemicals and include mutagens that are both direct‐acting and requiring metabolic activation. All the mutagens tested, except for ICR 191, elicited significant, concentration‐dependent increases in mutant frequency (MF) ranging from 2.6‐ to 14.4‐fold over the control. None of the four nonmutagens, including two misleading, or “false,” positives (i.e., tertiary butylhydroquinone [TBHQ] and eugenol), yielded any significant increases in MF. The benchmark dose covariate approach facilitated ranking of the positive chemicals from most (i.e., 3‐nitrobenzanthrone [3‐NBA], benzo[a]pyrene [BaP], and aflatoxin B1[AFB1]) to least (i.e.,N‐ethyl‐N‐nitrosourea [ENU]) potent. Overall, the results of this preliminary validation study suggest that this assay may serve as a complimentary tool alongside the standard genotoxicity test battery. This study, alongside Part I, illustrates the promise of MutaMouse PHs for use in anin vitrogene mutation assay, particularly for chemicals requiring metabolic activation. Environ. Mol. Mutagen. 60:348–360, 2019. © 2019 The Authors.Environmental and Molecular Mutagenesispublished by Wiley Periodicals, Inc. on behalf of Environmental Mutagen Society.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».