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Enregistrement W2921648918 · doi:10.1021/acs.estlett.9b00073

Molecular Initiating Events of Bisphenols on Androgen Receptor-Mediated Pathways Provide Guidelines for <i>in Silico</i> Screening and Design of Substitute Compounds

2019· article· en· W2921648918 sur OpenAlexaff
Qinchang Chen, Xiaoxiang Wang, Haoyue Tan, Wei Shi, Xiaowei Zhang, Si Wei, John P. Giesy, Hongxia Yu

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Science & Technology Letters · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEffects and risks of endocrine disrupting chemicals
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesGovernment of Jiangsu ProvinceMinistry of Science and Technology of the People's Republic of ChinaNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésIn silicoAndrogen receptorCorepressorAgonistLigand (biochemistry)ChemistryPharmacologyReceptorComputational biologyNuclear receptorBiochemistryBiologyTranscription factorGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bisphenols (BPs) have the potential to interfere with the androgen receptor (AR). However, in silico screening and substitute design were difficult because little was known about the mechanisms by which BPs interfere with AR-mediated molecular initiating events (MIEs). Here, the AR disrupting effects and associated mechanisms of 15 BPs were evaluated by in vitro assays and molecular dynamics simulations. AR-mediated MIEs, including ligand–receptor interactions and coregulator recruitment, might determine active versus inactive and agonist versus antagonist activities of BPs, respectively. Bisphenol E (BPE), BPF, and BPS with no binding effects were inactive, while all other BPs were AR antagonists. On the basis of their coregulator recruitment patterns and repositioning of helix 12, BPBP, BPC, and BPPH were passive antagonists that blocked coregulator recruitment, and their anti-androgenic potencies were correlated with ligand–receptor interactions; others were active antagonists that recruited corepressors, and their anti-androgenic potencies were correlated with ligand–receptor–corepressor interactions. A new method was developed for MIE-based in silico qualitative and quantitative evaluations of the potential of BPs to disrupt AR-mediated pathways, by which safer BPA substitutes with smaller and less hydrophobic connecting groups could be designed. The MIE-based in silico methods can be used to screen a wider range of chemicals and to design better substitutes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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