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Enregistrement W2921804231 · doi:10.1158/0008-5472.can-18-1545

SWI/SNF-Compromised Cancers Are Susceptible to Bromodomain Inhibitors

2019· article· en· W2921804231 sur OpenAlexafffund
Tatiana Shorstova, Maud Marques, Jie Su, Jake Johnston, Claudia L. Kleinman, Nancy Hamel, Sidong Huang, Moulay A. Alaoui‐Jamali, William D. Foulkes, Michael Witcher

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesJewish General HospitalSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Cancer InstituteGovernment of CanadaCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchFondation du cancer du sein du Québec
Mots-clésBromodomainSWI/SNFCancerMedicineCancer researchBiologyInternal medicineGeneticsTranscription factorEpigeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The antitumor activity of bromodomain and extraterminal motif protein inhibitors (BETi) has been demonstrated across numerous types of cancer. As such, these inhibitors are currently undergoing widespread clinical evaluation. However, predictive biomarkers allowing the stratification of tumors into responders and nonresponders to BETi are lacking. Here, we showed significant antiproliferative effects of low dosage BETi in vitro and in vivo against aggressive ovarian and lung cancer models lacking SMARCA4 and SMARCA2, key components of SWI/SNF chromatin remodeling complexes. Restoration of SMARCA4 or SMARCA2 promoted resistance to BETi in these models and, conversely, knockdown of SMARCA4 sensitized resistant cells to BETi. Transcriptomic analysis revealed that exposure to BETi potently downregulated a network of genes involved in receptor tyrosine kinase (RTK) signaling in SMARCA4/A2-deficient cells, including the oncogenic RTK HER3. Repression of signaling downstream of HER3 was found to be an important determinant of response to BETi in SMARCA4/A2-deficient cells. Overall, we propose that BETi represent a rational therapeutic strategy in poor-prognosis, SMARCA4/A2-deficient cancers. Significance: These findings address an unmet clinical need by identifying loss of SMARCA4/A2 as biomarkers of hypersensitivity to BETi.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,157
Score d'incertitude au seuil0,600

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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