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Enregistrement W2921823375 · doi:10.3198/jpr2018.06.0037crmp

Registration of the S2MET Barley Mapping Population for Multi‐Environment Genomewide Selection

2019· article· en· W2921823375 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Plant Registrations · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueWheat and Barley Genetics and Pathology
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesMinnesota Department of AgricultureU.S. Department of Agriculture
Mots-clésHordeum vulgareBiologySelection (genetic algorithm)CultivarPopulationGenomic selectionBiotechnologyTriticeaeGermplasmAgronomyGenotypeGeneticsGenomePoaceaeComputer scienceSingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Market changes in the malting and brewing industries have increased the demand for locally produced barley ( Hordeum vulgare L.) in many regions across North America. Breeding for productive barley cultivars in diverse growing environments is complicated by genotype × environment interactions (GEIs), which can make selection for broad adaptation difficult but may be exploited to select optimal cultivars for each environment. Genomewide selection has recently become a useful tool to make efficient selections on individuals using genomewide marker data. To support the use of genomewide selection to breed locally adapted barley cultivars, the University of Minnesota barley breeding program is publicly releasing a panel of two‐row barley lines, and accompanying data, called the S2MET (Spring Two‐Row Multi‐Environment Trial) (Reg. No. MP‐2, NSL 526938 MAP). The S2MET includes 233 breeding lines grouped into a 183‐line training population and a 50‐line validation population. The entire panel was genotyped using genotyping‐by‐sequencing and phenotyped for 14 important traits in 44 location‐year environments between 2015 and 2017. All data are freely available at the Triticeae Toolbox ( https://triticeaetoolbox.org/barley/ ), and we describe several on‐tap projects and breeding advances that are exploiting this resource. We believe this panel and dataset will be useful for answering important breeding questions related to genomewide selection and GEIs and developing locally superior barley cultivars.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,948
Score d'incertitude au seuil0,085

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle