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Enregistrement W2921951057 · doi:10.1093/jcag/gwz006.099

A100 THE ROLE OF EPS8 IN THE PATHOGENESIS OF PEDIATRIC INFLAMMATORY BOWEL DISEASE

2019· article· en· W2921951057 sur OpenAlexaff
Kurt Z. Long, Q Li, Conghui Guo, Neil Warner, S Zhang, Jingyun Pan, Gabriella Leung, Vritika Batura, Aleixo M. Muise

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPathogenesisInflammatory bowel diseaseMutationImmunologyBiologyDiseasePathologyMedicineGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The rate of onset for inflammatory bowel disease (IBD) is rising worldwide—most significantly in the pediatric population. The pathogenesis of the disease involves a complicated interaction between the environment and genetics. Recent findings suggest that there is a broad range of rare, single-gene mutations that correlated with the IBD phenotype in children. Some of these single-gene defects can disrupt the epithelial barrier, which alters intestinal immunity. Rare mutations in the Epidermal Growth Factor Receptor Substrate 8 (EPS8) gene has been reported in pediatric patients who presented with pancolitis, colonic strictures and other IBD-like symptoms. EPS8 has been shown to be involved in regulating actin polymerization; previously literature suggests that loss of EPS8 results in disruption of intestinal microvilli in C. Elegans and mice. The functional role of EPS8 in the pathogenesis of very early onset IBD remains elusive. We want to elucidate how a mutation in the EPS8 gene (I700T) affects the structure of a patient’s epithelial barrier. Ultimately, we want to clarify how the EPS8 variant contributes to the onset of pediatric IBD. We hypothesize that the EPS8 mutation will cause abberations in the actin structure of the patient’s intestinal epithelia. A pediatric patient with IBD was screened using whole exome sequencing (WES). Colon samples from the patient were collected and localization of EPS8 was visualized using immunofluorescence microscopy. Morphology of the intestinal microvilli will be assessed using transmission electron microscopy. Co-immunoprecipitation and immunoblot will be performed to evaluate the interaction of EPS8 signalling complex, which is involved in actin dynamics. WES data identified a patient with a homozygous recessive missense mutation in EPS8 (I700T), which was confirmed by Sanger sequencing. Immunofluorescence staining of the colonic sections revealed lower co-localization of EPS8 and beta-actin on the apical surfaces of epithelial cells, compared to IBD and normal controls. We predict that closer examination of the cell structure using electron microscopy will show disruption of the microvilli in the EPS8 mutant. Current findings suggest that the EPS8 mutant may disrupt microvilli actin organization in intestinal epithelial cells, which could contribute to the pathophysiology of pediatric IBD. Future experiments, such as intestinal organoid models, are necessary to confirm these results. CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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