The molecular hallmarks and clinical consequences of tumor hypoxia in prostate cancer.
Notice bibliographique
Résumé
81 Background: Localised prostate cancers are classified into risk-groups using clinical measurements like grade and stage to inform treatment decisions. However, these groupings are imprecise: ~30% of intermediate-risk patients suffer relapse of their disease despite precision image-guided radiotherapy or radical prostatectomy. One reason for this variability in response to treatment is the underlying cellular and molecular heterogeneity of tumours. Prostate tumour cells exist within a microenvironment characterized by gradients of oxygen levels and prostate tumours with low levels of oxygen (hypoxia) have poor clinical outcomes. Methods: Hypoxia was measured using multiple mRNA-based signatures. We examined 548 patients with localised prostate cancer and statistically assessed the association of hypoxia with copy-number alterations (CNAs), single-nucleotide variants (SNVs), genomic rearrangements, focal genomic events ( i.e. kataegis, chromothripsis), telomere length, clinical indices ( i.e. grade, stage) and subclonal architecture. Results: Elevated hypoxia was associated with allelic loss of PTEN, higher rates of chromothripsis and intraductal and cribriform carcinoma (IDC-CA). To translate these findings into a biomarker for prostate cancer precision medicine, we integrated tumour microenvironmental data with genomic and pathological information to stratify patients into distinct prognostic groups. Patients with localized prostate cancer that have polyclonal tumours with elevated hypoxia, allelic loss of PTEN and IDC-CA were at the highest risk of rapid biochemical failure (P = 3.48 x10-3, Logrank test) and metastasis (P = 4.61 x 10-3, Logrank test), even after controlling for T-category, Gleason score and pre-treatment PSA. Conclusions: These data suggest that the aggressiveness of prostate cancers is driven by the interplay of the tumour microenvironment, tumour evolutionary trajectories and its genomic mutational profile.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».