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Enregistrement W2922021164 · doi:10.1126/science.aat4042

Endocytosis of commensal antigens by intestinal epithelial cells regulates mucosal T cell homeostasis

2019· article· en· W2922021164 sur OpenAlexafffund
Mark S. Ladinsky, Leandro P. Araújo, Xiao Zhang, John Veltri, Marta Galán-Díez, Salima Soualhi, Carolyn Lee, Koichiro Irie, Elisha Y. Pinker, Seiko Narushima, Sheila Bandyopadhyay, Manabu Nagayama, Wael Elhenawy, Brian K. Coombes, Ronaldo P. Ferraris, Kenya Honda, Iliyan D. Iliev, Nan Gao, Pamela J. Björkman, Ivaylo I. Ivanov

Notice bibliographique

RevueScience · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNational Center for Complementary and Integrative HealthNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of General Medical SciencesAmerican Cancer SocietyCanadian Institutes of Health ResearchPew Charitable TrustsNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésEndocytosisCell biologyBiologyImmune systemSegmented filamentous bacteriaCDC42AntigenMicrobiologyCellClostridiaImmunologyBacteriaSignal transductionBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hooking into antigen transfer Segmented filamentous bacteria (SFB) are anaerobic, spore-forming, clostridia-like organisms that are important immune modulators in the mammalian gut. For some reason, SFB do not provoke inflammatory responses. Ladinsky et al. probed the mechanistic basis of this soothing effect in mice. SFB attach tightly to intestinal epithelial cells via a hook-like structure. Bacterial material is extruded from the hook and enters the host cell by endocytosis. An extruded SFB protein called P3340 is shuttled by the host protein cell division control protein 42 homolog (CDC42) through the endosomelysosome vesicular pathway to the basolateral side of the intestinal epithelial cell. Here, it prompts an immunomodulatory SFB-specific CD4 T helper 17 cell response, possibly via intestinal macrophages. Science , this issue p. eaat4042

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations169
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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