Mise au point d’un échafaudage moléculaire modulable pour le génie tissulaire
Notice bibliographique
Résumé
Je remercie avant tout mon directeur de recherche, le professeur Gregory De Crescenzo, de m'avoir offert la chance de réaliser une maîtrise recherche au sein de son laboratoire.Merci de m'avoir guidée tout au long de mon projet avec gentillesse et bienveillance, faisant de cette maîtrise une expérience enrichissante à la fois scientifiquement et humainement.Je remercie également le professeur Xavier Banquy, de la faculté de pharmacie de l'Université de Montréal qui, alors qu'il n'était pas officiellement mon co-directeur, m'a « adoptée » en cours de maîtrise et a suivi avec attention ma progression.Un grand merci à tous les membres de l'équipe et spécialement mes compagnons du « 2086 » : Benoit, Florian, Romane, Audrey et Fred.Merci pour votre aide, votre soutien et votre amitié !Merci aussi à celles qui sont restées moins longtemps, Celestine, Gwladys et Chloé, mais avec qui j'ai eu le plaisir de travailler.Merci enfin à toutes les personnes qui m'ont aidée et guidée dans mes expériences.Merci à Yuan pour son expertise et sa connaissance des laboratoires.Merci à Sylvie Bilodeau pour les innombrables spectres RMN qu'elle a réalisés pour mon projet.Merci à Colleen Matthieu pour m'avoir formée en histologie.Merci à Matthieu Gauthier pour les longues heures à regarder des gels au microscope électronique à balayage.Pour finir, je remercie bien évidemment ma famille et tous mes amis pour leur soutien sans faille dans tous mes projets !RÉSUMÉ Les hydrogels sont devenus, au cours des dernières décennies, très populaires, particulièrement dans le domaine du biomédical.Du fait de leur grande ressemblance aux tissus vivants, ils sont fréquemment utilisés dans le génie tissulaire comme échafaudages pour la culture cellulaire.La fonctionnalisation de ces polymères par des biomolécules permet de s'approcher des conditions naturelles des cellules et ainsi d'obtenir des tissus biologiques plus performants pour les applications médicales.Cependant, malgré les nombreux progrès effectués dans le domaine, l'immobilisation de protéines sur un polymère reste un défi.En effet, les protéines sont des macromolécules fragiles et sensibles à leur environnement.Pour préserver leur bioactivité, il ne faut pas ou peu modifier leur structure et correctement les présenter à leurs partenaires cellulaires.Pour cela, l'utilisation de peptides intermédiaires a fait ses preuves.Parmi eux, le couple Ecoil/Kcoil est particulièrement intéressant du fait de la forte affinité entre les deux peptides et permet également une bonne orientation et présentation du facteur de croissance aux cellules.L'objectif du projet été de réaliser un hydrogel de dextrane poreux, permettant l'adhésion, la prolifération et la migration des cellules, et fonctionnalisé avec des peptides Kcoils pour permettre l'immobilisation et la relâche contrôlée de facteurs de croissance couplés au peptide Ecoil par génie génétique.L'immobilisation du Kcoil sur le dextrane s'est révélée délicate due à l'oxydation extrêmement rapide du peptide.Une première étude sur la réduction simultanée à la réaction de greffage a été réalisée, aboutissant au manuscrit « Adequate reducing conditions enable conjugation to polymer by one pot thiol click chemistry », accepté dans le journal Bioconjugate chemistry et présenté dans le chapitre 4 du mémoire.En parallèle, une autre réaction chimique, la cycloaddition azide/alcyne a été envisagée.Celle-ci a donné des résultats concluants quant au greffage des peptides et a permis de réaliser des tests préliminaires sur les hydrogels.Malheureusement, les propriétés mécaniques et de porosité de l'hydrogel n'ont pas été atteintes pour réaliser une culture cellulaire en son sein.v
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».