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Enregistrement W2924502206 · doi:10.1117/12.2518295

Real time label-free monitoring of plasmonic polymerase chain reaction products

2019· article· en· W2924502206 sur OpenAlexaff
Gideon Uchehara, Andrew G. Kirk, Mark Trifiro, Miltiadis Paliouras, Padideh Mohammadyousef

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiosensors and Analytical Detection
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPolymerase chain reactionComputer scienceReplicateNanotechnologyComputational biologyMaterials scienceBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The high mortality rate in developing countries stemming from poverty and diseases, and the pressure on healthcare budgets in developed countries have evoked a major concern in healthcare delivery. The need for less costly and patient-centered healthcare delivery brings point-of-care testing (PoCT) to the fore. PoCT devices help to eliminate the overheads associated with centralized bench-top laboratory instruments. Although, handheld devices such as Glucose biosensor strip exist, small handheld PoCT devices for molecular techniques such as Polymerase Chain Reaction (PCR) used to provide infectious disease testing are new and emerging.Polymerase Chain Reaction (PCR) is a biological technique used to amplify DNA. PCR makes it possible to replicate DNA and generate millions of copies from a single strand of DNA. This finds applications in the medical field to identify and detect infectious diseases. PCR is also a very important component of every laboratory involved in molecular biology experimentation. Conventional PCR equipment is expensive and require a significant amount of personnel time and space to setup and run in the laboratory. Another critical aspect of PCR systems is the need to detect amplified products, but this ability is lacking in most conventional PCR systems. Given this background, the aim of this work is to demonstrate a simple, cheap, effective and patient-centered PCR systems to mediate the shortcomings of conventional PCR machines especially as it concerns the detection of amplified PCR products.Different methods for the detection of PCR products are described. Some of them are relatively insensitive and nonspecific while others are very sensitive and highly specific. The merits and demerits of each method are also outlined.In this work, I have exploited the phase shift between the temperature and transmission output during PCR cycle to demonstrate a low cost and easy label-free plasmonic photodetection of PCR products using a simple probe laser. This method makes it possible to distinguish between negative and positive PCRs, and it can detect PCR product with starting copy number as low as 10,000 genome copies per microliter.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil0,315

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,197
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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