Real time label-free monitoring of plasmonic polymerase chain reaction products
Notice bibliographique
Résumé
The high mortality rate in developing countries stemming from poverty and diseases, and the pressure on healthcare budgets in developed countries have evoked a major concern in healthcare delivery. The need for less costly and patient-centered healthcare delivery brings point-of-care testing (PoCT) to the fore. PoCT devices help to eliminate the overheads associated with centralized bench-top laboratory instruments. Although, handheld devices such as Glucose biosensor strip exist, small handheld PoCT devices for molecular techniques such as Polymerase Chain Reaction (PCR) used to provide infectious disease testing are new and emerging.Polymerase Chain Reaction (PCR) is a biological technique used to amplify DNA. PCR makes it possible to replicate DNA and generate millions of copies from a single strand of DNA. This finds applications in the medical field to identify and detect infectious diseases. PCR is also a very important component of every laboratory involved in molecular biology experimentation. Conventional PCR equipment is expensive and require a significant amount of personnel time and space to setup and run in the laboratory. Another critical aspect of PCR systems is the need to detect amplified products, but this ability is lacking in most conventional PCR systems. Given this background, the aim of this work is to demonstrate a simple, cheap, effective and patient-centered PCR systems to mediate the shortcomings of conventional PCR machines especially as it concerns the detection of amplified PCR products.Different methods for the detection of PCR products are described. Some of them are relatively insensitive and nonspecific while others are very sensitive and highly specific. The merits and demerits of each method are also outlined.In this work, I have exploited the phase shift between the temperature and transmission output during PCR cycle to demonstrate a low cost and easy label-free plasmonic photodetection of PCR products using a simple probe laser. This method makes it possible to distinguish between negative and positive PCRs, and it can detect PCR product with starting copy number as low as 10,000 genome copies per microliter.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».