Real time label-free monitoring of plasmonic polymerase chain reaction products
Notice bibliographique
Résumé
The high mortality rate in developing countries stemming from poverty and diseases, and the pressure on healthcare budgets in developed countries have evoked a major concern in healthcare delivery. The need for less costly and patientcentered healthcare delivery brings point-of-care (POC) testing to the fore. POC devices help to eliminate the overhead associated with centralized bench-top laboratory instruments. Although handheld devices such as glucose biosensor strip exist, POC devices for molecular techniques such as Polymerase Chain Reaction (PCR) are new and emerging. PCR makes it possible to replicate DNA and generate millions of copies from a single strand. This finds applications in the medical field to identify and detect infectious diseases. Conventional PCR equipment is expensive and requires a significant amount of personnel time and space to setup and run in the laboratory. We have recently demonstrated a rapid and low-cost PCR thermocycler based on laser heating of gold nanoparticles suspended in the PCR tube. A critical aspect of PCR systems is the need to detect amplified products in real time. Here we show that by measuring the optical absorption of the suspended gold nanoparticles at a single wavelength during thermocycling, it is possible to detect amplified PCR products in real time. We investigate several different signal processing approaches in order to determine the most sensitive monitoring technique. This method makes it possible to distinguish between negative and positive PCRs with starting copy numbers as low as 10,000 genome copies per microliter.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».