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Enregistrement W2924785753 · doi:10.1212/nxg.0000000000000317

Somatic expansion of the <i>C9orf72</i> hexanucleotide repeat does not occur in ALS spinal cord tissues

2019· article· de· W2924785753 sur OpenAlexafffund
Jay P. Ross, Claire S. Leblond, Hélène Catoire, Kathryn Volkening, Michael J. Strong, Lorne Zinman, Janice Robertson, Patrick A. Dion, Guy A. Rouleau

Notice bibliographique

RevueNeurology Genetics · 2019
Typearticle
Languede
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science CentreOccupational Cancer Research CentreMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesSchulich School of Medicine and DentistryUniversity of TorontoMcGill University
Mots-clésC9orf72Amyotrophic lateral sclerosisBiologyTrinucleotide repeat expansionSpinal cordSomatic cellAnatomyGeneticsPathologyMedicineGeneNeuroscienceDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<h3>Objective</h3> To test for somatic <i>C9orf72</i> hexanucleotide repeat expansion (HRE) and hexanucleotide repeat length instability in the spinal cord of amyotrophic lateral sclerosis (ALS) cases. <h3>Methods</h3> Whole and partial spinal cords of 19 ALS cases were dissected into transversal sections (5 mm thick). The presence of <i>C9orf72</i> HRE was tested in each independent section using RepeatPrimed PCR and amplicon-size genotyping. Index measures for the testing of mosaicism were obtained through serial dilutions of genomic DNA from an individual carrying a germline <i>C9orf72</i> HRE in the genomic DNA of an individual without a <i>C9orf72</i> HRE. <h3>Results</h3> None of the sections examined supported the presence of a subpopulation of cells with a <i>C9orf72</i> HRE. Moreover, the <i>C9orf72</i> hexanucleotide repeat lengths measured were identical across all the spinal cord sections of each individual patient. <h3>Conclusions</h3> We did not observe somatic instability of the <i>C9orf72</i> HRE in disease relevant tissues of ALS cases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,348
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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