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Enregistrement W2925251483 · doi:10.1139/cjps-2018-0188

Characterization and expression analysis of <i>GPAT</i> gene family in maize

2019· article· en· W2925251483 sur OpenAlexvenueno aff
Xiaoxuan Xu, Bowei Yan, Zhao Ying, Feng Wang, Xunchao Zhao, Lin He, Jingyu Xu, Changjiang Zhao

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneBiologyGene expressionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glycerol-3-phosphate acyltransferase (GPAT) catalyzes the initial step of glycerolipids biosynthesis and contributes to oil production, membrane stabilization, and stress responses in plants. In major field crops, little information on the GPAT gene family and their potential stress-related functions were available. In this study, 15 GPAT gene family members were identified from the maize genome and designated as ZmGPAT1–ZmGPAT14 and ZMS1. The ZmGPAT proteins contained 371–557 amino acids and had a molecular weight between 42.7 and 61.2 kDa. Phylogenetic analysis revealed that ZmGPATs fell into four clusters. All 15 ZmGPAT proteins possessed conserved PlsC/LPLAT (phosphate acyltransferases/lysophospholipid acyltransferases) domains and featured multiple acyltransferase motifs. The expression profiles of ZmGPAT genes were different in various tissues of maize and the elevated expression of several ZmGPAT genes occurred at early seed developmental stages. In response to environmental stresses, differential expression of ZmGPATs had been observed, highlighted by the significant induction of transcripts accumulation of some ZmGPATs under cold treatment. This study will help to better understand the potential roles of GPAT in oil production and development and abiotic stress responses in field crops.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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