<i>De novo</i> genome assembly of the white-spotted flower chafer (<i>Protaetia brevitarsis</i>)
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Protaetia brevitarsis, commonly known as the white-spotted flower chafer, is an important Scarabaeidae insect that is distributed in most Asian countries. Recently, research on the insect's harmfulness to crops, usefulness in agricultural waste utilization, edibility, medicinal value, and usability in insect immunology has provided sufficient impetus to demonstrate the need for a detailed study of its biology. Herein, we sequenced the whole genome of this species to improve our understanding and study of P. brevitarsis. FINDINGS: We developed a highly reliable genome resource for P. brevitarsis (Lewis, 1879; Coleoptera: Cetoniinae) using Illumina and PacBio sequencing platforms. A total of 135.75 gigabases (Gb) was generated, providing 150-fold coverage based on the 810-megabases (Mb) estimated genome size. The assembled P. brevitarsis genome was 751 Mb (including the scaffolds longer than 2 kilobases (kb)) with 327 scaffolds, and the N50 length of the assembly was 2.94 Mb. A total of 34,110 (22,229 in scaffolds and 11,881 located in alleles) genes were identified using Evidence Modeler, which was based on the gene prediction results obtained from 3 different methods (ab initio, RNA sequencing based, and known gene based). CONCLUSIONS: We assembled a high-quality P. brevitarsis genome, which will not only provide insight into the biology of the species but also provide a wealth of information that will inform researchers on the evolution, control, and utilization of P. brevitarsis.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle