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Enregistrement W2928679018 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-18-2683

Ultra-sensitive <i>EGFR</i> T790M Detection as an Independent Prognostic Marker for Lung Cancer Patients Harboring <i>EGFR</i> del19 Mutations and Treated with First-generation TKIs

2019· article· en· W2928679018 sur OpenAlexaff
Julie A. Vendrell, Julien Mazières, Romain Senal, Isabelle Rouquette, Xavier Quantin, Jean-Louis Pujol, Benoît Roch, Abdelali Bouidioua, Sylvain Godreuil, Étienne Coyaud, Pierre Brousset, Jérôme Solassol

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésT790MLung cancerMutationMedicineDigital polymerase chain reactionInternal medicineOncologyCancerIncidence (geometry)Clinical significanceTyrosine kinaseCancer researchEpidermal growth factor receptorBiologyGenePolymerase chain reactionGefitinibGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Purpose: The detection of preexisting EGFRT790M subclones and the assessment of their clinical significance in the pretreatment of patients with EGFRT790M non–small cell lung cancer (NSCLC) remain unclear. Experimental Design: A total of 179 tumor samples from patients treated or not with a first-generation tyrosine kinase inhibitor (TKI) was analyzed. The presence of ultra-low levels of preexisting EGFRT790M mutation was evaluated using ultra-sensitive droplet digital PCR (ddPCR) and the clinical implication of these mutations on first-generation TKI efficiency assessed. Results: With a ddPCR linear performance of 0.999 and an analytical sensitivity of approximately 0.001%, we observed a 66% (99/150) overall incidence of ultra-low EGFRT790M mutation. Among 82 patients harboring EGFRactivating mutations, the presence of a preexisting EGFRT790M mutation prior to any treatment was significantly associated with a longer progression-free survival (PFS; P = 0.009; log-rank test). Interestingly, longer PFS was linked to concomitant EGFRdel19 and ultra-low EGFRT790M mutations. Moreover, the presence of both EGFRdel19 and ultra-low EGFRT790M mutations was identified as the best fit for predicting the clinical outcome of patients treated with TKI compared with an ultra-low EGFRT790M mutation status or an activating mutation alone (P = 0.042 and P = 0.0071, respectively). Conclusions: We demonstrate that the detection of the ultra-low EGFRT790M mutation in TKI-naïve patients is not a rare event. We suggest that ddPCR should be used in clinical practice to distinguish patients who may respond to first- or third-generation TKIs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,457
Écart entre enseignants0,392 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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