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Enregistrement W2928790165 · doi:10.1038/s41579-019-0187-4

New filovirus disease classification and nomenclature

2019· review· en· W2928790165 sur OpenAlexafffund
Jens H. Kuhn, Takuya Adachi, Neill K. J. Adhikari, José Ramón Arribas, Ibrahima Bah, Daniel G. Bausch, Nahid Bhadelia, Matthias Borchert, Arne Broch Brantsæter, David M. Brett‐Major, Timothy Burgess, Daniel S. Chertow, Christopher G. Chute, Theodore J. Cieslak, Robert Colebunders, Ian Crozier, Richard T. Davey, Hilde De Clerck, Rafaël Delgado, Laura Evans, Mosoka Fallah, William A. Fischer, Tom Fletcher, Robert Fowler, Thomas Grünewald, Andy Hall, Angela Hewlett, Andy I. M. Hoepelman, Catherine Houlihan, Giuseppe Ippolito, Shevin T. Jacob, Michael Jacobs, Robert Jakob, Frédérique Jacquérioz, Laurent Kaiser, André C. Kalil, Rashidatu Fouad Kamara, Jimmy Kapetshi, Hans‐Dieter Klenk, Gary Kobinger, Mark G. Kortepeter, Colleen S. Kraft, Thomas Kratz, Henry Kyobe Bosa, Marta Lado, François Lamontagne, H. Cliff Lane, Leslie Lobel, Julius J. Lutwama, G. Marshall Lyon, Moses Massaquoi, Thomas Massaquoi, Aneesh K. Mehta, Vital Mondonge Makuma, Srinivas Murthy, Tonny Seikikongo Musoke, Jean‐Jacques Muyembé‐Tamfum, Phiona Nakyeyune, Carolina Nanclares, Miriam Nanyunja, Justus Nsio-Mbeta, Tim O’Dempsey, Janusz T. Pawęska, C. J. Peters, Peter Piot, C. Rapp, Bertrand Renaud, Bruce S. Ribner, Pardis C. Sabeti, John S. Schieffelin, Werner Slenczka, Moses J Soka, Armand Sprecher, James E. Strong, Robert Swanepoel, Timothy M. Uyeki, Michel Van Herp, Pauline Vetter, David A. Wohl, Timo Wolf, Anja Wolz, Alie Wurie, Zabulon Yoti

Notice bibliographique

RevueNature Reviews Microbiology · 2019
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of British ColumbiaUniversité de SherbrookeUniversité LavalHealth Sciences CentreUniversity of TorontoInstitute for Clinical Evaluative SciencesSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesNIH Clinical CenterNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesSchool of Medicine, Emory UniversityUniformed Services University of the Health SciencesCenters for Disease Control and PreventionNational Institutes of HealthRobert Koch InstitutUniversité de ParisUniversiteit AntwerpenHôpitaux Universitaires de GenèveUniversitetet i OsloUniversity of TorontoNational Health Laboratory ServiceMinistero della SaluteNational Cancer InstituteKing's Health PartnersNHLBI Division of Intramural ResearchPublic Health AgencyUniversity of PretoriaNYU Langone Medical CenterFrederick National Laboratory for Cancer ResearchKing's College LondonNational Institute for Health and Care ResearchNational Institute for Health Research Health Protection Research UnitRoyal Free London NHS Foundation TrustUniversity of Nebraska Medical CenterFaculty of Medicine, University of British ColumbiaDepartment of Health and Social CareInstitute for Clinical Evaluative SciencesPublic Health Agency of CanadaPhilipps-Universität MarburgUniversité LavalTulane UniversityEmory UniversityBattelleWorld Health OrganizationUniversité de SherbrookeJohns Hopkins UniversitySchool of Medicine, University of North Carolina at Chapel HillNational Center for Immunization and Respiratory DiseasesBroad InstituteKoch Institute for Integrative Cancer Research, Massachusetts Institute of TechnologyMassachusetts Institute of Technology
Mots-clésEbola virusOutbreakDiseaseBiologyEbolavirusVirologyGenotypeGeneticsMedicinePathologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0070,004
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,108
Tête enseignante GPT0,440
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations127
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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