Insights into the antigenic advancement of influenza A(H3N2) viruses, 2011–2018
Notice bibliographique
Résumé
Influenza A(H3N2) viruses evade human immunity primarily by acquiring antigenic changes in the haemagglutinin (HA). HA receptor-binding features of contemporary A(H3N2) viruses hinder traditional antigenic characterization using haemagglutination inhibition and promote selection of HA mutants. Thus, alternative approaches are needed to reliably assess antigenic relatedness between circulating viruses and vaccines. We developed a high content imaging-based neutralization test (HINT) to reduce antigenic mischaracterization resulting from virus adaptation to cell culture. Ferret reference antisera were raised using clinical specimens containing viruses representing recent vaccine strains. Analysis of viruses circulating during 2011-2018 showed that gain of an N158-linked glycosylation in HA was a molecular determinant of antigenic distancing between A/Hong Kong/4801/2014-like (clade 3C.2a) and A/Texas/50/2012-like viruses (clade 3C.1), while multiple evolutionary HA F193S substitution were linked to antigenic distancing from A/Switzerland/97152963/2013-like (clade 3C.3a) and further antigenic distancing from A/Texas/50/2012-like viruses. Additionally, a few viruses carrying HA T135K and/or I192T showed reduced neutralization by A/Hong Kong/4801/2014-like antiserum. Notably, this technique elucidated the antigenic characteristics of clinical specimens, enabling direct characterization of viruses produced in vivo, and eliminating in vitro culture, which rapidly alters the genotype/phenotype. HINT is a valuable new antigenic analysis tool for vaccine strain selection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».