Linking morphological and molecular taxonomy for the identification of poultry house, soil, and nest dwelling mites in the Western Palearctic
Notice bibliographique
Résumé
Because of its ability to expedite specimen identification and species delineation, the barcode index number (BIN) system presents a powerful tool to characterize hyperdiverse invertebrate groups such as the Acari (mites). However, the congruence between BINs and morphologically recognized species has seen limited testing in this taxon. We therefore apply this method towards the development of a barcode reference library for soil, poultry litter, and nest dwelling mites in the Western Palearctic. Through analysis of over 600 specimens, we provide DNA barcode coverage for 35 described species and 70 molecular taxonomic units (BINs). Nearly 80% of the species were accurately identified through this method, but just 60% perfectly matched (1:1) with BINs. High intraspecific divergences were found in 34% of the species examined and likely reflect cryptic diversity, highlighting the need for revision in these taxa. These findings provide a valuable resource for integrative pest management, but also highlight the importance of integrating morphological and molecular methods for fine-scale taxonomic resolution in poorly-known invertebrate lineages.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».