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Enregistrement W2932705805 · doi:10.1093/jme/tjz042

Molecular Phylogeny of Dermacentor parumapertus (Acari: Ixodidae) from Two Locations Within Its Geographical Range

2019· article· en· W2932705805 sur OpenAlexaboutno aff
José Santos Portugal, Michelle Allerdice, Gail Miriam Moraru, Jonas G. King, Christopher D. Paddock, Tom Becker, Travis C. Smith, Jerome Goddard

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Entomology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGoddard Space Flight Center
Mots-clésIxodidaeAcariBiologyDermacentorRange (aeronautics)ZoologyParasitiformesPhylogeneticsGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Dermacentor parumapertus Neumann (Acari: Ixodidae) is a rather obscure tick found on jackrabbits in the western United States and parts of Canada and Mexico. Specimens from the northern part of their range are consistently different morphologically from ones found in southern and eastern parts of their range (particularly west Texas), leading some researchers to declare the southern form a variety or subspecies. This study examined field-collected adult D. parumapertus from two main locations-Utah and Texas-within its geographic distribution to ascertain the degree of genetic divergence in the two populations based upon both nuclear and mitochondrial DNA sequences. In total, 30 D. parumapertus were analyzed by PCR using both mtDNA and nDNA genes, and one D. nitens was included for comparison. Trees were constructed for all mtDNA genes individually, as well as after concatenating mtDNA (COI, COII, 12S) and nDNA (2 ITS2 primers), respectively. All constructed trees were exported to FigTree v1.4.3 and TreeGraph v2.14.1-771 beta for visualization. The majority of the Utah and Texas populations of D. parumapertus separated molecularly in both mtDNA and nDNA trees; however, analysis with mtDNA genes showed that 3/13 (23%) of Utah tick specimens were removed molecularly from other specimens collected at the same location. Thus, there was not enough evidence to declare these two disparate and morphologically different populations as distinct and separate species.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,306
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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