Epigenetics, Built Environment and Atopy
Notice bibliographique
Résumé
RationaleAccurate estimation of gestational age (GA) using DNA methylation (DNAm) of umbilical cord blood, a novel development, provides relevant information on developmental stage. Studies of environmental exposures on GA are plentiful, but not using DNAm GA. We evaluated associations between DNAm GA, environmental correlates of the built environment and atopy.MethodsCord blood samples from 145 selected participants in the Canadian Healthy Infant Longitudinal Development study were examined, together with allergy skin prick tests at age 1 year.Exposure to greenness using satellite imagery, and individual exposure estimates to air pollution using land use regression models were assessed at home addresses throughout pregnancy.Associations of air pollution and greenness with DNAm GA residuals were tested while adjusting for maternal and neonatal characteristics. We further examined whether sensitization related to these environmental factors and DNAm GA.ResultsThe mean GA was 276 (SD: 7.9) days, and mean DNAm GA was 279(5.8) days. There was a significantly positive correlation between these measues (r=0.66; p<0.001).Prenatal exposure to greenness showed borderline association with DNAm GA acceleration (i.e., older DNAm GA than chronological GA) (0.6 days, 95% CI: [-.6; 1.8] for one IQR exposure increase). Conversely, DNAm GA deceleration (i.e., younger DNAm GA) was associated with air pollution exposure during the first trimester (-2.1 days [-4.8; 0.7] for a 10 μg/m3 exposure increase).29% of this atopy-enriched sub-cohort were sensitized to at least one of 10 allergens. DNAm GA was a strong predictor of decreased risk of sensitization (OR: 0.93, 95%CI: [0.88; 0.99]), while air pollution exposure modestly increased the risk of sensitization by 4% (p=0.1).ConclusionOur findings warrant in depth investigation of potential mediating role of DNA methylation on the association between allergic disorders and the built environment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».