Meta‐analysis supports further refinement of eDNA for monitoring aquatic species‐specific abundance in nature
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The use of eDNA to detect the presence/absence of rare or invasive species is well documented and its use in biodiversity monitoring is expanding. Preliminary laboratory research has also shown a positive correlation between the concentration of species‐specific eDNA particles and the density/biomass of a species in a given environment. However, the extent to which these results can be extended to natural environments has yet to be formally quantified. We collated data from experiments that examined the correlation between eDNA and two metrics of abundance (biomass and density) and, using mixed‐effects meta‐analysis, quantified the strength of that correlation across laboratory and natural environments. We found that eDNA particle concentration was more strongly correlated with abundance in laboratory environments compared to natural environments, accounting for approximately 82% and 57% of the observed variation in abundance, respectively. We found some evidence of potential publication bias that may have impacted the estimation of the correlation in natural environments; after smaller studies were removed from the dataset, eDNA particle concentration accounted for approximately 50% of the observed variation in abundance in natural environments. No effect of abundance metric was found on the strength of correlation between eDNA particle concentration and abundance. Despite a weaker general correlation in natural environments, eDNA concentration often still explained substantial variation in abundance. eDNA research is still an emergent field of study; with only moderate improvements in technology or technique, it could represent a powerful new tool for quantifying abundance.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,056 | 0,123 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,006 | 0,021 |
| Bibliométrie | 0,007 | 0,008 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,005 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».