MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2938588715 · doi:10.21105/joss.01272

NeuroDSP: A package for neural digital signal processing

2019· article· en· W2938588715 sur OpenAlexfundno aff
Scott R. Cole, Thomas Donoghue, Richard Gao, Bradley Voytek

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Open Source Software · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeural dynamics and brain function
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of California, San DiegoNational Science Foundation
Mots-clésComputer scienceSignal processingDigital signal processingComputer graphics (images)Computer hardware

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Populations of neurons exhibit time-varying fluctuations in their aggregate activity. These data are often collected using common magneto- and electrophysiological methods, such as magneto or electroencephalography (M/EEG), intracranial EEG (iEEG) or electrocorticography (ECoG), and local field potential (LFP) recordings (Buzsáki, Anastassiou, &Koch, 2012). While there are existing Python tools for digital signal processing (DSP),such as scipy.signal, neural data exhibit specific properties that warrant specialized analysis tools focused on idiosyncrasies of neural data. Features of interest in neural data include periodic properties—such as band-limited oscillations (Buzsáki & Draguhn, 2004)and transient or ‘bursty’ events—as well as an aperiodic signal that is variously referred to as the 1/f-like background (Freeman & Zhai, 2009; Miller, Sorensen, Ojemann, & Nijs,2009), or noise (Voytek et al., 2015), or scale-free activity (He, 2014), and that may carry information about the current generators, such as the ratio of excitation and inhibition(Gao, Peterson, & Voytek, 2017). NeuroDSP is a package specifically designed to be used by neuroscientists for analyzing neural time series data, in particular for examing their time-varying properties related to oscillatory and 1/f-like components.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,111
Score d'incertitude au seuil0,371

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1110,051

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations88
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Open Source SoftwareMême sujetNeural dynamics and brain functionTravaux en français237 207