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Enregistrement W2940582390 · doi:10.1002/humu.23771

Mutation update for the <i>SATB2</i> gene

2019· review· en· W2940582390 sur OpenAlexaff
Yuri A. Zárate, Katherine A. Bosanko, Aislling R. Caffrey, Jonathan A. Bernstein, Donna M. Martin, Marc S. Williams, Elizabeth Berry‐Kravis, Paul R. Mark, Melanie A. Manning, Vikas Bhambhani, Marcelo Alves Vargas, Andrea Seeley, Juvianee Estrada‐Veras, Marieke F. van Dooren, Maria Schwab, Adeline Vanderver, Daniela Melis, Adnan Alsadah, Laurie S. Sadler, Hilde Van Esch, Bert Callewaert, Ann Oostra, Jane MacLean, Maria Lisa Dentici, Valeria Orlando, Mark Lipson, Steven Sparagana, Timothy J. Maarup, Suzanne Alsters, Ariel Brautbar, Eliana Kovitch Thropp, Sakkubai Naidu, Melissa Lees, Douglas M. Smith, Lesley Turner, Víctor Raggio, Lucía Spangenberg, Sixto García‐Miñáur, Elizabeth Roeder, Rebecca O. Littlejohn, Dorothy K. Grange, Jean P. Pfotenhauer, Marilyn C. Jones, Meena Balasubramanian, Antonio Federico Martínez‐Monseny, Lot Snijders Blok, Ralitza Gavrilova, Jennifer L. Fish

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeVlaamse regering
Mots-clésBiologyMissense mutationGeneticsPhenotypeGeneExpansiveGenotype-phenotype distinctionGenotypeMutationCoding region

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SATB2-associated syndrome (SAS) is an autosomal dominant neurodevelopmental disorder caused by alterations in the SATB2 gene. Here we present a review of published pathogenic variants in the SATB2 gene to date and report 38 novel alterations found in 57 additional previously unreported individuals. Overall, we present a compilation of 120 unique variants identified in 155 unrelated families ranging from single nucleotide coding variants to genomic rearrangements distributed throughout the entire coding region of SATB2. Single nucleotide variants predicted to result in the occurrence of a premature stop codon were the most commonly seen (51/120 = 42.5%) followed by missense variants (31/120 = 25.8%). We review the rather limited functional characterization of pathogenic variants and discuss current understanding of the consequences of the different molecular alterations. We present an expansive phenotypic review along with novel genotype-phenotype correlations. Lastly, we discuss current knowledge of animal models and present future prospects. This review should help provide better guidance for the care of individuals diagnosed with SAS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,995
Score d'incertitude au seuil0,771

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,373
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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