An international perspective on genetic structure and gene flow in Cercospora beticola populations
Notice bibliographique
Résumé
Cercospora leaf spot, caused by the fungus Cercospora beticola Sacc., is an important disease of Beta vulgaris L. (table beet, sugar beet, and Swiss chard) worldwide. Disease impacts include reductions in commodity grading, and quantity and quality of extractable sugars from sugar beet roots. Conidia of C. beticola disperse locally by water or wind to initiate and expand disease foci in fields. Mechanisms for long distance pathogen dispersal and epidemic initiation are largely unknown. Studies of populations from Western Europe, Iran, New Zealand, Turkey, and the USA reported high levels of genetic diversity. Moreover, in some populations, equal ratios of two mating types suggests an active, and potentially mobile, teleomorph. In Europe, long distance dispersal of C. beticola is implied by evidence of high levels of gene flow between isolates across the region, resulting in a single panmictic population. Furthermore, recurrent clonal lineages shared between the USA and Europe provided evidence for intercontinental genotype flow. The genetic relationships among C. beticola isolates from nine countries (Canada (n=37), Chile (n=28), Denmark (n=9), England (n=9), Germany (n=10), Italy (n=11), Sweden (n=8), Turkey (n=7), and four states in the USA (n=1073)) were assessed using 12 microsatellite markers. This information \nwill indicate the potential movement of C. beticola between regions and has implications for global disease management.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».