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Enregistrement W2943431893

Molecular basis of calcicole-calcifuge physiology

2008· dissertation· en· W2943431893 sur OpenAlexaboutno aff
Sunil Choudhary Cherukuri

Notice bibliographique

RevueLancaster EPrints (Lancaster University) · 2008
Typedissertation
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAluminum toxicity and tolerance in plants and animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEcotypeTrichomeBiologyCalcareousRoot hairNutrientBotanyArabidopsis thalianaCalcareous soilsSoil waterAdaptation (eye)EcologyGeneMutantBiochemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Calcium (Ca2+) is an essential plant nutrient that plays a key role in plant growth and development and an essential second messenger that controls a variety of cellular functions. It also plays a role in cellular regulation of plant cell signaling. Plants rely on the unique properties of Ca2+ for a range of structural, enzymatic, and signaling functions. Of the many nutrients essential for normal growth and development of plants, Ca2+ occupies a unique position both chemically and functionally. Soils vary widely in their Ca2+ content and therefore, adaptations shown by plants, mainly to this factor, have led to the emergence of two very distinct ecological divisions termed as calcicoles (grow on calcareous soils) and calcifuges (grow on acidic soils). As excess Ca2+ is toxic to plants the sequestering of incoming Ca2+ as Ca2+ oxalate in epidermal trichomes has been studied in calcicoles from high Ca2+ enriched environments (calcareous soils). However, much less is known about the molecular basis of adaptation to this ecological phenomenon as well as the morphological adaptation patterns of calcicoles and calcifuges in response to varied levels of rhizospheric Ca2+. In this study, six ecotypes of A. thaliana, comprising two putative wild calcifuges (Glenisla and Penicuik), two putative wild calcicoles (Halifax and Elland) collected from varyingly calcareous regions around UK, and two lab grown ecotypes (Col-4 and Cal-0) were subjected to varied concentrations of Ca2+ stress under invitro conditions and a difference in growth and morphology of these ecotypes was measured. Also, DNA microarray analysis was utilized to detect genes that are regulated by Ca2+. A differed pattern in the root growth was observed in all the ecotypes at varied external Ca2+ application ranging from 0 mM to 30 mM. The primary root structure and growth differed markedly in Glenisla plants grown at 30 mM Ca2+. TUNEL assay determined the occurrence of apoptosis in the same Glenisla roots. Also, ten repressed Calcium-responsive genes in Cal-0 (Cal-CRGs) at high Ca2+ were investigated in all the six ecotypes using Real time RT-PCR, demonstrating their differed expression patterns in putative calcicoles to putative calcifuges. Analysis of SALK T-DNA knockout Cal-CRG5 and Cal-CRG17 lines, revealed the potential role of repression of these genes in rhizospheric Ca2+ tolerance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,857
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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