The permanent inhabitant of the oak trees: phylogeography and genetic structure of the Persian squirrel (Sciurus anomalus)
Notice bibliographique
Résumé
The Persian squirrel (Sciurus anomalus) is a keystone species in the Middle East’s woodlands and oak forests. We investigated the phylogeography of the species using two partial mitochondrial (D-loop, Cyt b) and two nuclear (Rag1, Cmyc) markers with extensive sampling throughout the range of the species in the Irano-Anatolian region. Phylogenetic analyses using Bayesian and maximum likelihood methods and haplotype networks demonstrated two well-supported lineages of S. anomalus in the study area, including one lineage (comprising three groups) in Anatolia and another lineage (comprising two groups) in the Levant region and Zagros forests. The Anatolian and Levantine populations are found entirely in humid coastal regions, whereas the Zagros populations are associated with continental climatic conditions. No shared haplotypes and no evidence of gene flow (based on FST statistics) were observed among the groups. Analysis indicated that the ancestral population of the species first evolved in western Anatolia and the Greek islands. Estimated divergence times of less than 1 Mya between the lineages, and among the groups within lineages, suggest that Pleistocene climatic fluctuations may have led to the isolation of the species in refugial areas during ice ages. Signs of population expansion indicate that subsequent postglacial expansion and diversification then shaped the current distribution pattern of the Persian squirrel.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».