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Enregistrement W2943534381 · doi:10.1093/biolinnean/blz032

The permanent inhabitant of the oak trees: phylogeography and genetic structure of the Persian squirrel (Sciurus anomalus)

2019· article· en· W2943534381 sur OpenAlexaff
Marzieh Asadi Aghbolaghi, Faraham Ahmadzadeh, Bahram H. Kiabi, Nusha Keyghobadi

Notice bibliographique

RevueBiological Journal of the Linnean Society · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueAnimal Ecology and Behavior Studies
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhylogeographyBiologySciurusLineage (genetic)PopulationEcologyRange (aeronautics)Genetic structureDemographic historyPhylogenetic treeZoologyGenetic variationHabitat

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Persian squirrel (Sciurus anomalus) is a keystone species in the Middle East's woodlands and oak forests. We investigated the phylogeography of the species using two partial mitochondrial (D-loop, Cyt b) and two nuclear (Rag1, Cmyc) markers with extensive sampling throughout the range of the species in the Irano-Anatolian region. Phylogenetic analyses using Bayesian and maximum likelihood methods and haplotype networks demonstrated two well-supported lineages of S. anomalus in the study area, including one lineage (comprising three groups) in Anatolia and another lineage (comprising two groups) in the Levant region and Zagros forests. The Anatolian and Levantine populations are found entirely in humid coastal regions, whereas the Zagros populations are associated with continental climatic conditions. No shared haplotypes and no evidence of gene flow (based on F ST statistics) were observed among the groups. Analysis indicated that the ancestral population of the species first evolved in western Anatolia and the Greek islands. Estimated divergence times of less than 1 Mya between the lineages, and among the groups within lineages, suggest that Pleistocene climatic fluctuations may have led to the isolation of the species in refugial areas during ice ages. Signs of population expansion indicate that subsequent postglacial expansion and diversification then shaped the current distribution pattern of the Persian squirrel.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,084
Score d'incertitude au seuil0,791

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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