MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2943604120 · doi:10.1101/627364

Dietary methionine restriction targets one carbon metabolism in humans and produces broad therapeutic responses in cancer

2019· preprint· en· W2943604120 sur OpenAlexfundno aff
Xia Gao, Sydney M. Sanderson, Ziwei Dai, Michael A. Reid, Daniel E. Cooper, Min Lu, John P. Richie, Amy Ciccarella, Ana Calcagnotto, Peter G. Mikhael, Samantha J. Mentch, Juan Liu, Gene P. Ables, David G. Kirsch, David S. Hsu, Sailendra N. Nichenametla, Jason W. Locasale

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthCanadian Institutes of Health ResearchPennsylvania State University
Mots-clésCancerColorectal cancerCancer researchMethionineBiologyBioinformaticsMedicineCancer cellMetabolic pathwayKRASMetabolismInternal medicineBiochemistryAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Nutrition exerts profound effects on health and dietary interventions are commonly used to treat diseases of metabolic etiology. Although cancer has a substantial metabolic component, the principles that define whether nutrition may be used to influence tumour outcome are unclear. Nevertheless, it is established that targeting metabolic pathways with pharmacological agents or radiation can sometimes lead to controlled therapeutic outcomes. In contrast, whether specific dietary interventions could influence the metabolic pathways that are targeted in standard cancer therapies is not known. We now show that dietary restriction of methionine (MR), an essential amino acid, and the reduction of which has aging and obesogenic properties, influences cancer outcome through controlled and reproducible changes to one carbon metabolism. This pathway metabolizes methionine and further is the target of a host of cancer interventions involving chemotherapy and radiation. MR produced therapeutic responses in chemoresistant RAS-driven colorectal cancer patient derived xenografts and autochthonous KRAS G12D +/− ; TP53 −/− -driven soft tissue sarcomas resistant to radiation. Metabolomics revealed the therapeutic mechanisms to occur through tumor cell autonomous effects on the flux through one carbon metabolism that impacted redox and nucleotide metabolism, thus interacting with the antimetabolite or radiation intervention. Finally, in a controlled and tolerated feeding study in humans, MR resulted in similar effects on systemic metabolism as obtained in responsive mice. These findings provide evidence that a targeted dietary manipulation can affect specific tumor cell metabolism to mediate broad aspects of cancer outcome.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetCancer, Hypoxia, and MetabolismTravaux en français237 207