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Enregistrement W2943628838 · doi:10.1101/622761

The effect of number of healthcare visits on study sample selection and prevalence estimates in electronic health record data

2019· preprint· en· W2943628838 sur OpenAlexaff
Laura J. Rasmussen‐Torvik, Al’ona Furmanchuk, Alexander J. Stoddard, Kristen Osinski, John Meurer, Nicholas Smith, Elizabeth A. Chrischilles, Bernard S. Black, Abel Kho

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2019
Typepreprint
Langueen
DomaineHealth Professions
ThématiqueMedical Coding and Health Information
Établissements canadiensKellogg's (Canada)
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCenters for Disease Control and PreventionNational Institutes of Health
Mots-clésSample (material)Electronic health recordMedicineHealth careSample size determinationSNOMED CTHealth dataFamily medicineStatisticsTerminologyMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Introduction Few studies have addressed how to select a study sample when using electronic health record (EHR) data. Methods Year 2016 EHR data from three health systems was used to examine how alternate definitions of the study sample, based on number of healthcare visits in one year, affected measures of disease period prevalence. Curated collections of ICD-9, ICD-10, and SNOMED codes were used to define three diseases. Results Across all health systems, increasing the minimum required number of visits to be included in the study sample monotonically increased crude period prevalence estimates. The rate at which prevalence estimates increased with number of visits varied across sites and across diseases. Conclusions When using EHR data authors must carefully describe how a study sample is identified and report outcomes for a range of sample definitions, so that others can assess the sensitivity of reported results to sample definition in EHR data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,008
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0080,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,076
Tête enseignante GPT0,405
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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