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Enregistrement W2943847800 · doi:10.1210/js.2019-sat-546

SAT-546 Discovering the Function of IGSF1 and Its Role in the Hypothalamic-Pituitary-Thyroid Axis

2019· article· en· W2943847800 sur OpenAlexaff
Courtney L. Smith, Daniel J. Bernard

Notice bibliographique

RevueJournal of the Endocrine Society · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueThyroid Disorders and Treatments
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCell biologyIntracellularBiologyTransmembrane proteinExtracellularPituitary glandHormoneReceptorInternal medicineEndocrinologyBiochemistryMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Loss of function mutations in the X-linked immunoglobulin superfamily, member 1 (IGSF1) gene cause congenital central hypothyroidism, hypoprolactinemia, macroorchidism, and the dysregulation of growth hormone and pubertal development. IGSF1 is a type 1 transmembrane protein of unknown function that is highly expressed in the pituitary gland, choroid plexus, and developing liver. The mature form of the protein contains seven extracellular Ig loops, a single transmembrane domain, and a short intracellular carboxyl tail rich in serine and threonine residues. Although the function of IGSF1 is presently unknown, the topology of the protein suggests that it plays a role in intercellular communication. Two Igsf1 knockout mouse models exhibit reduced pituitary TRH receptor (Trhr1) expression and associated impairments in TRH-stimulated TSH secretion. How the loss of IGSF1 leads to reductions in Trhr1 levels is unresolved. We hypothesize that IGSF1 acts in concert with intracellular signaling molecules to regulate Trhr1 expression. To date, IGSF1 has been shown to interact with only two proteins, itself and the thyroid hormone transporter MCT8. However, MCT8 has low expression in the pituitary and IGSF1 does not alter MCT8-dependent thyroid hormone transport. Therefore, we implemented a new proximity labelling method, BioID, to characterize the intracellular IGSF1 interactome and ultimately determine IGSF1’s role in Trhr1 regulation. We expressed an IGSF1-BirA* fusion protein in heterologous cells and confirmed that it properly traffics to the plasma membrane. Moreover, the protein auto-biotinylates and labels other, currently unidentified proteins. IGSF1-BirA* maintains its ability to interact with MCT8, but does not interact with an intracellular signaling protein recently implicated in central hypothyroidism, insulin receptor substrate 4 (IRS4). We are stably expressing IGSF1-BirA* in heterologous and homologous cell lines, HEK293 and HepG2 (human hepatocellular carcinoma), respectively, for the BioID screen. We will purify biotinylated proteins and identify them using mass spectrometry. In follow-up analyses, we will focus on proteins that link IGSF1 to known signaling pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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