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Enregistrement W2944088748 · doi:10.1016/j.ekir.2019.04.018

Intrafamilial Variability of ADPKD

2019· article· en· W2944088748 sur OpenAlexafffundabout
Matthew B. Lanktree, Elsa Guiard, Weili Li, Pedram Akbari, Amirreza Haghighi, Ioan-Andrei Iliuta, Belili Shi, Chen Chen, Ning He, Xuewen Song, Peter J. Margetts, Alistair J. Ingram, Korosh Khalili, Andrew D. Paterson, York Pei

Notice bibliographique

RevueKidney International Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Kidney Cyst Diseases
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health NetworkSickKids FoundationPublic Health OntarioHospital for Sick ChildrenMcMaster University
Organismes subventionnairesKidney Foundation of CanadaCanadian Society of NephrologyAmerican Society of Nephrology
Mots-clésAutosomal dominant polycystic kidney diseasePKD1MedicineProbandPolycystic kidney diseaseCohortRenal functionDiseaseInternal medicineKidney diseaseGenetic epidemiologyMutationPathologyGeneticsBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction Discordance in kidney disease severity between affected relatives is a recognized feature of autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD). Here, we report a systematic study of a large cohort of families to define the prevalence and clinical features of intrafamilial discordance in ADPKD. Methods The extended Toronto Genetic Epidemiology Study of Polycystic Kidney Disease (eTGESP) cohort includes 1390 patients from 612 unrelated families with ADPKD ascertained in a regional polycystic kidney disease center. All probands underwent comprehensive PKD1 and PKD2 mutation screening. Total kidney volume by magnetic resonance imaging (MRI) was available in 500 study patients. Results Based on (i) rate of estimated glomerular filtration rate (eGFR) decline, (ii) age at onset of end-stage renal disease (ESRD), and (iii) Mayo Clinic Imaging Classification (MCIC), 20% of patients were classified as having mild disease, and 33% as having severe disease. Intrafamilial ADPKD discordance with at least 1 mild and 1 severe case was observed in 43 of 371 (12%) families, at a similar frequency regardless of the responsible gene ( PKD1/PKD2/ no mutation detected) or mutation type (protein-truncating versus nontruncating). Intrafamilial discordance was more common in larger families and was present in 30% of families with more than 5 affected members. The heritability of age at onset of ESRD was similar between different mutation types. Conclusion Extreme kidney disease discordance is present in at least 12% of families with ADPKD, regardless of the underlying mutated gene or mutation class. Delineating genetic and environmental modifiers underlying the observed intrafamilial ADPKD variability will provide novel insights into the mechanisms of progression in ADPKD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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