DEAD-box protein family member DDX28 is a negative regulator of HIF-2α and eIF4E2-directed hypoxic translation
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Hypoxia occurs when there is a deficiency in oxygen delivery to tissues and is connected to physiological and pathophysiological processes such as embryonic development, wound healing, heart disease and cancer. The master regulators of oxygen homeostasis in mammalian cells are the heterodimeric hypoxia-inducible transcription factors HIF-1 and HIF-2. The oxygen-labile HIF-2α subunit has not only been implicated in transcription, but also as a regulator of eIF4E2-directed hypoxic translation. Here, we have identified the DEAD-box protein family member DDX28 as a novel interactor and negative regulator of HIF-2α that suppresses its ability to activate eIF4E2-directed translation. We demonstrate that stable silencing of DDX28 via shRNA in hypoxic human U87MG glioblastoma cells caused an increase, relative to control, to: HIF-2α protein levels, the ability of eIF4E2 to bind the m 7 GTP cap structure, and the translation of select eIF4E2 target mRNAs. DDX28 depletion elevated both nuclear and cytoplasmic HIF-2α, but HIF-2α transcriptional activity did not increase possibly due to its already high nuclear abundance in hypoxic control cells. Depletion of DDX28 conferred a proliferative advantage to hypoxic, but not normoxic cells, which is likely a consequence of the translational upregulation of a subset of hypoxia-response mRNAs. DDX28 protein levels are reduced in several cancers, including glioma, relative to normal tissue. Therefore, we uncover a regulatory mechanism for this potential tumor suppressor in the repression of HIF-2α- and eIF4E2-mediated translation activation of oncogenic mRNAs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».