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Enregistrement W2944804656 · doi:10.3390/genes10050364

Outcome Definition Influences the Relationship between Genetic Polymorphisms of ERCC1, ERCC2, SLC22A2 and Cisplatin Nephrotoxicity in Adult Testicular Cancer Patients

2019· article· en· W2944804656 sur OpenAlexafffundabout
Zulfan Zazuli, Leila S. Otten, Britt I. Drögemöller, Mara Medeiros-Domingo, Jose Gerard Monzon, Galen E.B. Wright, Christian Kollmannsberger, Philippe L. Bédard, Zhuo Chen, Karen A. Gelmon, Nicole McGoldrick, Abhijat Kitchlu, Susanne J. H. Vijverberg, Rosalinde Masereeuw, Colin J.D. Ross, Geoffrey Liu, Bruce Carleton, Anke H. Maitland‐van der Zee

Notice bibliographique

RevueGenes · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChemotherapy-induced organ toxicity mitigation
Établissements canadiensOccupational Cancer Research CentreUniversity Health NetworkBC Children's HospitalUniversity of TorontoPrincess Margaret Cancer CentreBC Cancer AgencyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBC Children's HospitalMichael Smith Health Research BCLembaga Pengelola Dana PendidikanGenome British ColumbiaCanadian Institutes of Health ResearchGenome Canada
Mots-clésERCC2ERCC1CisplatinNephrotoxicityTesticular cancerOncologyMedicineBiologyGeneticsInternal medicineGenotypeCancerSingle-nucleotide polymorphismChemotherapyGeneDNA repairNucleotide excision repairToxicity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although previous research identified candidate genetic polymorphisms associated with cisplatin nephrotoxicity, varying outcome definitions potentially contributed to the variability in the effect size and direction of this relationship. We selected genetic variants that have been significantly associated with cisplatin-induced nephrotoxicity in more than one published study (SLC22A2 rs316019; ERCC1 rs11615 and rs3212986; ERCC2 rs1799793 and rs13181) and performed a replication analysis to confirm associations between these genetic polymorphisms and cisplatin nephrotoxicity using various outcome definitions. We included 282 germ cell testicular cancer patients treated with cisplatin from 2009–2014, aged >17 years recruited by the Canadian Pharmacogenomics Network for Drug Safety. Nephrotoxicity was defined using four grading tools: (1) Common Terminology Criteria for Adverse Events (CTCAE) v4.03 for acute kidney injury (AKI) or CTCAE-AKI; (2) adjusted cisplatin-induced AKI; (3) elevation of serum creatinine; and (4) reduction in the estimated glomerular filtration rate (eGFR). Significant associations were only found when using the CTCAE v4.03 definition: genotype CA of the ERCC1 rs3212986 was associated with decreased risk of cisplatin nephrotoxicity (ORadj = 0.24; 95% CI: 0.08–0.70; p = 0.009) compared to genotype CC. In contrast, addition of allele A at SLC22A2 rs316019 was associated with increased risk (ORadj = 4.41; 95% CI: 1.96–9.88; p < 0.001) while genotype AC was associated with a higher risk of cisplatin nephrotoxicity (ORadj = 5.06; 95% CI: 1.69–15.16; p = 0.004) compared to genotype CC. Our study showed that different case definitions led to variability in the genetic risk ascertainment of cisplatin nephrotoxicity. Therefore, consensus on a set of clinically relevant outcome definitions that all such studies should follow is needed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,449

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations24
Publié2019
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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