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Enregistrement W2945133581 · doi:10.1080/23802359.2019.1614891

The complete mitochondrial and plastid genomes of <i>Corallina chilensis</i> (Corallinaceae, Rhodophyta) from Tomales Bay, California, USA

2019· article· en· W2945133581 sur OpenAlexaboutno aff
Ivan A. Alejo, Teresa E. Aleman, Karina Almanza, William Alonso, Maria Guadalupe Altamirano Manriquez, Tyler Armbrister, Yoshio Astudillo, Lyric Batistiana, Jonathan S. Blas Guido, Danilo E. Bustamante, Martha S. Calderón, Jovany D. Camacho Gonzalez, Suiry Cardoso, José Marcos de Castro, Maria N. Chombo Garcia, Lissa P. Colin, Karina G. Cortina, Andrea Delgado, Daniel Espinoza Castro, Isabel Estrada, Eduardo Felix, Stephanie Felix, Martin Flores, Suzanne Frausto, Eli D. Garcia, Malia Garcia, Gabriela Gasca, Daniela Gómez, Christian Gonzalez Balcazar, Bianca G. Miramontes, Víctor M González, Clarissa D. Guzman, Edgard C. Guzman, Timothy B. Hanneman, Julissa M. Hernandez, Jeffery R. Hughey, Victoria N. Hutchins, Eli R. Kallison, Sebastian Lepe, Serena M. Lopez, Feifei Zhai Lorenzo, Evelyn Macias Reyes, Fernando Martínez Madrigal, Nayeli G. Madrigal-Gonzalez, Rodolfo Mandujano, Ricardo M. Manzo, Paloma L. Martinez, Sergio Martı́nez, Bianey A. Medina, Mario F. Mendez, Jose J. Mendoza Contreras, Ana I. Meza, Kevin Miller, Anna Deeny Morales, Eduardo Muñoz, Johnna M. Myers, Priya-Anjali Patel, Dominic Pina Montes, Alejandra N. Ponce, Alicia E. Ramirez, Elías Rico, Aide Rodriguez, Jasmine Rodriguez, Ángel Ruíz, Andrea Saldana, Angélica Gutiérrez-Sánchez, Jessica D. Santana, Francisco D. Solano, Alejandra Soto Trujillo, Sarai J. Soto, Alicia Steinhardt, Melisa Talavera, Monik M. Tapia, Odalis Tapia, Maria O. Taveras Dina, Brenda J. Torresillas, Clarissa Vazquez-Ramos, Frances Wong

Notice bibliographique

RevueMitochondrial DNA Part B · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine and coastal plant biology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPlastidGenBankBayGenomeMitochondrial DNASyntenyEvolutionary biologyGeneBotanyGeneticsChloroplastOceanography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genomic analysis of the marine alga Corallina chilensis from Tomales Bay, California, USA, resulted in the assembly of its complete mitogenome (GenBank accession number MK598844) and plastid genome (GenBank MK598845). The mitogenome is 25,895 bp in length and contains 50 genes. The plastid genome is 178,350 bp and contains 233 genes. The organellar genomes share a high-level of gene synteny to other Corallinales. Comparison of rbcL and cox1 gene sequences of C. chilensis from Tomales Bay reveals it is identical to three specimens from British Columbia, Canada and very similar to a specimen of C. chilensis from southern California. These genetic data confirm that C. chilensis is distributed in Pacific North America.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,085

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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