MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2945366030 · doi:10.1128/mbio.00826-19

Comparative Loss-of-Function Screens Reveal ABCE1 as an Essential Cellular Host Factor for Efficient Translation of <i>Paramyxoviridae</i> and <i>Pneumoviridae</i>

2019· article· en· W2945366030 sur OpenAlexafffund
Danielle E. Anderson, Kristin Pfeffermann, So Young Kim, Bevan Sawatsky, James L. Pearson, Mikhail Kovtun, David L. Corcoran, Yvonne Krebs, Kristmundur Sigmundsson, Sharon F. Jamison, Zhen Zhen Joanna Yeo, Linda J. Rennick, Lin‐Fa Wang, Pierre J. Talbot, W. Paul Duprex, Mariano A. García-Blanco, Veronika von Messling

Notice bibliographique

RevuemBio · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRespiratory viral infections research
Établissements canadiensArmand Frappier MuseumInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchIndependent Electricity System OperatorNational Medical Research CouncilCanada Foundation for InnovationDeutsches Zentrum für InfektionsforschungWashington State Department of Natural ResourcesUniversity of Washington
Mots-clésTranslation (biology)Host (biology)Function (biology)VirologyBiologyCell biologyMessenger RNAGeneBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

families include important human and animal pathogens. To identify common host factors, we performed genome-scale siRNA screens with wild-type-derived measles, mumps, and respiratory syncytial viruses in the same cell line. A comparative bioinformatics analysis yielded different members of the coatomer complex I, translation factors ABCE1 and eIF3A, and several RNA binding proteins as cellular proteins with proviral activity for all three viruses. A more detailed characterization of ABCE1 revealed its essential role for viral protein synthesis. Taken together, these data sets provide new insight into the interactions between paramyxoviruses and pneumoviruses and host cell proteins and constitute a starting point for the development of broadly effective antivirals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,059
Score d'incertitude au seuil0,655

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuemBioMême sujetRespiratory viral infections researchTravaux en français237 207