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Enregistrement W2946172770 · doi:10.1134/s0003683819020108

Improving the Thermostability and pH Stability of Aspergillus niger Xylanase by Site-directed Mutagenesis

2019· article· en· W2946172770 sur OpenAlexfundno aff
Qiang Li, Tao Wu, Yuting Duan, Jianjun Pei, Linguo Zhao

Notice bibliographique

RevueApplied Biochemistry and Microbiology · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaGraduate Research and Innovation Projects of Jiangsu ProvincePriority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education InstitutionsPetroleum Technology Research Centre
Mots-clésThermostabilityAspergillus nigerXylanaseEnzymeChemistrySite-directed mutagenesisBiochemistryHomology modelingActive siteMutagenesisDirected evolutionAmino acidEnzyme assayMutationMutantGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract To increase the thermostability and pH stability of the recombinant xylanase MxynB from the Aspergillus niger nl-1, site-directed mutagenesis method was selected by rational approaches based on the three-dimensional structures using a homology modeling of mxynB constructed by SWISS-MODEL and BLAST. The effect of disulphide in the structure of xylanase was studied to increase the optimum temperature and thermostability of enzyme, the variant MxynB-116-135 which was created with amino acid residues substitutions G116C+Y135C by site-directed mutagenesis had its reaction temperature for the maximum activity at 50oC, which corresponded to a basic 10oC unit increase compared with the wild-type enzyme. Moreover, the thermostability of A. niger nl-1 xylanase after mutation MxynB-G116C-Y135C-D76R-N28H-N29D-Y45M-N47L was clearly increased by 570% as compared with the wild-type enzyme under 70oC. In addition, the optimal activity pH of the enzyme after the mutations MxynB-G116C-Y135C-D76R-N28H-N29D-Y45M-N47L and MxynB-G116C-Y135C-S58H-D76R-N28H-N29D-Y45M-N47L raised from 4.5 to 6.0, meanwhile, the pH stabilities were increased from 120 to 194% compared with the wild-type enzyme under pH 5.0 to 7.0. All the results suggest that these amino acid residues are important in determining the thermostability and pH stability of MxynB from Aspergillus niger nl-1, which will raise its potential interest for the industrial applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,385

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,157
Écart entre enseignants0,154 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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