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Enregistrement W2947121292 · doi:10.3389/fevo.2020.00081

Using Environmental DNA to Monitor the Reintroduction Success of the Rhine Sculpin (Cottus rhenanus) in a Restored Stream

2020· article· en· W2947121292 sur OpenAlexaff
Christopher A. Hempel, Bianca Peinert, Arne J. Beermann, Vasco Elbrecht, Jan‐Niklas Macher, Till‐Hendrik Macher, Gunnar Jacobs, Florian Leese

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Ecology and Evolution · 2020
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésElectrofishingSculpinCottusEnvironmental DNABiological dispersalThreatened speciesBiomonitoringEcologyBiologyPopulationFisheryFreshwater ecosystemIndicator speciesBiodiversityEcosystemAbundance (ecology)Fish <Actinopterygii>Habitat

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Freshwaters belong to the most threatened ecosystems with some of the highest rates of species loss. To decrease these high extinction rates, ecological restorations are increasingly applied to restore and maintain the good ecological status of freshwaters. Their ecological status can be determined by assessing the presence of indicator species (e.g. certain fish species), which is called biomonitoring. However, traditional biomonitoring of fish, such as electrofishing, is often challenging and invasive. To augment traditional biomonitoring of fish, the analysis of environmental DNA (eDNA) has recently been proposed as an alternative, sensitive approach. The present study employed this modern approach to monitor the Rhine sculpin (Cottus rhenanus), a fish species that has been reintroduced into a recently restored stream within the Emscher catchment in Germany, in order to validate the success of the applied restorations. We monitored the dispersal of the Rhine sculpin using replicated 12S end-point PCR eDNA surveillance at a fine spatial and temporal scale. In that way, we investigated if eDNA analysis can be applied for freshwater assessments. We also performed traditional electrofishing in one instance to validate our eDNA-based approach. We could track the dispersal of the Rhine sculpin and showed a higher dispersal potential of the species than we assumed. We validated the species’ dispersal across a potential dispersal barrier via eDNA detection and showed a steep increase of positive detections once the reintroduced population had established. In contrast to that, false negative eDNA results occurred at early reintroduction stages. Our results show that eDNA detection can be used to validate and monitor reintroductions and to contribute to the assessment and modelling of ecological status of streams.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,319

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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