MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2947303722 · doi:10.1002/minf.201900024

Molecular Modelling of Potential Candidates for the Treatment of Depression

2019· article· en· W2947303722 sur OpenAlexaff
Daniela Rodrigues Silva, Stephen J. Barigye, Letícia Santos‐Garcia, Elaine F. F. da Cunha

Notice bibliographique

RevueMolecular Informatics · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior
Mots-clésPharmacophoreQuantitative structure–activity relationshipComputational biologySerotonin transporterDocking (animal)Mode of actionIsoquinolineChemistryPharmacologySerotoninStereochemistryBiologyMedicineReceptorBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract A lot of research initiatives in the last decades have been focused on the search of new strategies to treat depression. However, despite the availability of various antidepressants, current treatment is still far from ideal. Unwanted side effects, modest response rates and the slow onset of action are the main shortcomings. As a strategy to improve symptomatic relief and response rates, the dual modulation of the serotonin transporter and the histamine H3 receptor by a single chemical entity has been proposed in the literature. Accordingly, this work aims to elucidate key structural features responsible for the dual inhibitory activity of the hexahydro‐pyrrolo‐isoquinoline derivatives. For this purpose, two approaches were employed, four‐dimensional quantitative structure‐activity relationship (4D‐QSAR) and molecular docking. The 4D‐QSAR models for both receptors allowed the identification of the pharmacophore groups critical for the modelled biological activity, whereas the binding mode of this class of compounds to the human serotonin transporter was assessed by molecular docking. The findings can be applicable to design new antidepressants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular InformaticsMême sujetComputational Drug Discovery MethodsTravaux en français237 207