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Enregistrement W2947332097 · doi:10.1038/s41598-019-44536-1

Neoplastic Transformation of Human Mesenchymal Stromal Cells Mediated via LIN28B

2019· article· en· W2947332097 sur OpenAlexaff
Radhakrishnan Vishnubalaji, Ramesh Elango, Mashael Al-Toub, Muthurangan Manikandan, Ammar C. Al‐Rikabi, Linda Harkness, Nicholas Ditzel, Muhammad Atteya, Rimi Hamam, Musaad Alfayez, Abdullah Aldahmash, Moustapha Kassem, Nehad M. Alajez

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesQatar National LibraryTehran University of Medical Sciences and Health ServicesKing Saud University
Mots-clésMesenchymal stem cellStromal cellTransformation (genetics)Cell biologyComputational biologyComputer scienceCancer researchBiologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bone marrow stromal (Mesenchymal) stem cells (MSCs) are multipotent bone cells capable of differentiating into mesoderm-type cells, such as osteoblasts and adipocytes. Existing evidence suggests that transformation of MSCs gives rise to sarcoma. In order to identify the molecular mechanism leading to spontaneous transformation of human bone marrow MSCs (hBMSCs), we performed comprehensive microRNA (miRNA) and mRNA profiling in the transformed hBMSC-Tum line compared to the parental clone. As a result, we identified multiple dysregulated molecular networks associated with the hBMSC transformed phenotype. LIN28B was upregulated 177.0-fold in hBMSC-Tum, which was associated with marked reduction in LET-7 expression and upregulated expression of its target HMGA2. Targeted depletion of LIN28B or exogenous expression of LET-7b suppressed hBMSC-Tum proliferation, colony formation, and migration. On the other hand, forced expression of LIN28B promoted malignant transformation of parental hBMSC cells as shown by enhanced in vitro colony formation, doxorubicin resistance, and in vivo tumor formation in immunocompromised mice. Analysis of LIN28B and HMGA2 expression levels in cohorts from The Cancer Genome Atlas sarcoma dataset revealed a strong inverse-relationship between elevated expression and overall survival (OS) in 260 patients (p = 0.005) and disease-free survival (DFS) in 231 patients (p = 0.02), suggesting LIN28B and HMGA2 are important regulators of sarcoma biology. Our results highlight an important role for the LIN28B/LET-7 axis in human sarcoma pathogenesis and suggest that the therapeutic targeting of LIN28B may be relevant for patients with sarcoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,536

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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