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Enregistrement W2948055130 · doi:10.1176/appi.ajp.2019.18080957

GWAS of Suicide Attempt in Psychiatric Disorders and Association With Major Depression Polygenic Risk Scores

2019· review· en· W2948055130 sur OpenAlexfundno aff
Niamh Mullins, Tim B. Bigdeli, Anders D. Børglum, Jonathan R. I. Coleman, Ditte Demontis, Divya Mehta, Robert A. Power, Stephan Ripke, Eli A. Stahl, Anna Starnawska, Adebayo Anjorin, Aiden Corvin, Alan R. Sanders, Andreas J. Forstner, Andreas Reif, Anna C. Koller, Beata Świątkowska, Bernhard T. Baune, Bertram Müller-Myhsok, Brenda W.J.H. Penninx, Carlos N. Pato, Clement C. Zai, Dan Rujescu, David M. Hougaard, Digby Quested, Douglas F. Levinson, Elisabeth B. Binder, Enda M. Byrne, Esben Agerbo, Fabian Streit, Fermín Mayoral, Frank Bellivier, Franziska Degenhardt, Gerome Breen, Gunnar Morken, Gustavo Turecki, Guy A. Rouleau, Hans J. Grabe, Henry Völzke, Ian Jones, Ina Giegling, Ingrid Agartz, Ingrid Melle, Jacob Lawrence, James Walters, Jana Strohmaier, Jianxin Shi, Joanna Hauser, Joanna M. Biernacka, John B. Vincent, John R. Kelsoe, John S. Strauss, Jolanta Lissowska, Jonathan Pimm, Jordan W. Smoller, José Guzmán‐Parra, Laura J. Scott, Lisa Jones, Maria Helena Pinto de Azevedo, Maciej Trzaskowski, Manolis Kogevinas, Marcella Rietschel, Marco P. Boks, Marcus Ising, Maria Grigoroiu‐Serbânescu, Marian L. Hamshere, Marion Leboyer, Mark A. Frye, Markus M. Nöthen, Martin Alda, Martin Preisig, Merete Nordentoft, Michael Boehnke, Michael O‘Donovan, Michael J. Owen, Michele T. Pato, Miguel E. Rentería, Monika Budde, Myrna M. Weissman, Naomi R. Wray, Nicholas Bass, Nicholas Craddock, Olav B. Smeland, Ole A. Andreassen, Ole Mors, Pablo V. Gejman, Pamela Sklar, Patrick J. McGrath, Per Hoffmann, Peter McGuffin, Phil H. Lee, Preben Bo Mortensen, René S. Kahn, Roel A. Ophoff, Rolf Adolfsson, Sandra Van der Auwera, Srdjan Djurovic, Stefan Kloiber, Stefanie Heilmann‐Heimbach, Stéphane Jamain, Steven P. Hamilton, Susan L. McElroy, Susanne Lucae, Sven Cichon, Thomas G. Schulze, Thomas Folkmann Hansen, Thomas Werge, Tracy Air, Vishwajit L. Nimgaonkar, Vivek Appadurai, Wiepke Cahn, Yuri Milaneschi, Ayman H. Fanous, Kenneth S. Kendler, Andrew McQuillin, Cathryn M. Lewis

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Psychiatry · 2019
Typereview
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueSuicide and Self-Harm Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCilagNational Institute of Mental HealthFaculty of Medicine and Health, University of SydneyNIHR Maudsley Biomedical Research CentreMedical Research CouncilMontreal Neurological Institute and HospitalSUNY Downstate Medical CenterSchool of Medicine, Emory UniversityNational Institutes of HealthNeuraxpharmH. Lundbeck A/SAssistance publique-Hôpitaux de ParisMitsubishi Tanabe Pharma CorporationRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnJohns Hopkins UniversityUniversité Paris DiderotUniversitetet i BergenUniversitair Medisch Centrum UtrechtStatens Serum InstitutGGZ inGeestNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekState University of New YorkQueensland University of TechnologyInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleFresenius Medical Care North AmericaTrinity College DublinVrije Universiteit AmsterdamUniversity of OxfordJ. Willard and Alice S. Marriott FoundationKing's College LondonNational Institute for Health and Care ResearchUniversitätsmedizin GöttingenTeva Pharmaceutical IndustriesUmeå UniversitetNorthShore University HealthSystemSunovionNorges Teknisk-Naturvitenskapelige UniversitetNorthwestern UniversityMayo Foundation for Medical Education and ResearchMcGill UniversityAarhus UniversitetUniversität BaselUniversity of LouisvilleUniversity of CincinnatiUniversity of PittsburghBrainsWayBroad InstituteLundbeckfondenAssurex HealthKaiser PermanenteAllerganRush UniversityF. Hoffmann-La RocheGenomic HealthWestfälische Wilhelms-Universität MünsterQueensland Brain InstituteUniversity of QueenslandEmory UniversityMassachusetts General HospitalWayne State UniversityMinistry of Education, IndiaRobert Bosch StiftungNovo NordiskUniversity of Pennsylvania
Mots-clésBipolar disorderMajor depressive disorderPsychiatrySuicide attemptGenome-wide association studyMood disordersDepression (economics)Schizophrenia (object-oriented programming)PsychologyPoison controlMoodClinical psychologyMedicineSuicide preventionSingle-nucleotide polymorphismGenotypeAnxietyGeneticsMedical emergency

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: More than 90% of people who attempt suicide have a psychiatric diagnosis; however, twin and family studies suggest that the genetic etiology of suicide attempt is partially distinct from that of the psychiatric disorders themselves. The authors present the largest genome-wide association study (GWAS) on suicide attempt, using cohorts of individuals with major depressive disorder, bipolar disorder, and schizophrenia from the Psychiatric Genomics Consortium. Methods: The samples comprised 1,622 suicide attempters and 8,786 nonattempters with major depressive disorder; 3,264 attempters and 5,500 nonattempters with bipolar disorder; and 1,683 attempters and 2,946 nonattempters with schizophrenia. A GWAS on suicide attempt was performed by comparing attempters to nonattempters with each disorder, followed by a meta-analysis across disorders. Polygenic risk scoring was used to investigate the genetic relationship between suicide attempt and the psychiatric disorders. Results: Three genome-wide significant loci for suicide attempt were found: one associated with suicide attempt in major depressive disorder, one associated with suicide attempt in bipolar disorder, and one in the meta-analysis of suicide attempt in mood disorders. These associations were not replicated in independent mood disorder cohorts from the UK Biobank and iPSYCH. No significant associations were found in the meta-analysis of all three disorders. Polygenic risk scores for major depression were significantly associated with suicide attempt in major depressive disorder (R2=0.25%), bipolar disorder (R2=0.24%), and schizophrenia (R2=0.40%). Conclusions: This study provides new information on genetic associations and demonstrates that genetic liability for major depression increases risk for suicide attempt across psychiatric disorders. Further collaborative efforts to increase sample size may help to robustly identify genetic associations and provide biological insights into the etiology of suicide attempt.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,326
Écart entre enseignants0,311 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations285
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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