Oncogenic mutations in histologically normal endometrium: the new normal?
Notice bibliographique
Résumé
The advent of next generation sequencing has vastly improved the resolution of mutation detection, thereby both increasing the resolution of the analysis of cancer tissues and shining light on the existence of somatic driver mutations in normal tissues, even in the absence of cancer. Studies have described somatic driver mutations in normal skin, blood, peritoneal washings, and esophageal epithelium. Such findings prompt speculation on whether such mutations exist in other tissues, such as the eutopic endometrium in particular, due to the highly regenerative nature of the endometrium and the recent observation of recurrent somatic driver mutations in deep infiltrating and iatrogenic endometriosis (tissues believed to be derived from the eutopic endometrium) by our group and others. In the current study we investigated the presence of somatic driver mutations in histologically normal endometrium from women lacking evidence of gynecologic malignancy or endometrial hyperplasia. Twenty-five women who underwent hysterectomies and 85 women who underwent endometrial biopsies were included in this study. Formalin-fixed, paraffin-embedded tissue specimens were analyzed by means of targeted sequencing followed by orthogonal validation with droplet digital PCR. PTEN and ARID1A immunohistochemistry (IHC) was also performed as surrogates for inactivating mutations in the respective genes. Overall, we observed somatic driver-like events in over 50% of normal endometrial samples analyzed, including hotspot mutations in KRAS, PIK3CA, and FGFR2 as well as PTEN-loss by IHC. Analysis of anterior and posterior samplings collected from women who underwent hysterectomies was consistent with the presence of somatic driver mutations within clonal pockets spread throughout the uterus. The prevalence of such oncogenic mutations also increased with age (OR: 1.05 [95% CI: 1.00-1.10], p = 0.035). These findings have implications on our understanding of aging and so-called 'normal tissues', thereby necessitating caution in the utilization of mutation-based early detection tools for endometrial or other cancers. © 2019 Pathological Society of Great Britain and Ireland. Published by John Wiley & Sons, Ltd.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,003 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».