Amyloid accumulation drives proteome-wide alterations in mouse models of Alzheimer’s disease like pathology
Notice bibliographique
Résumé
Summary Amyloid beta (Aβ) peptides impair multiple cellular pathways in the brain and play a causative role in Alzheimer’s disease (AD) pathology, but how the brain proteome is remodeled during this process is unknown. To identify new protein networks associated with AD-like pathology, we performed global quantitative proteomic analysis in three mouse models at pre- and post-symptomatic ages. Our analysis revealed a robust and consistent increase in Apolipoprotein E (ApoE) levels in nearly all transgenic brain regions with increased Aβ levels. Taken together with prior findings on ApoE driving Aβ accumulation, this analysis points to a pathological dysregulation of the ApoE-Aβ axis. We also found dysregulation of protein networks involved in excitatory synaptic transmission consistent with AD pathophysiology. Targeted analysis of the AMPA receptor complex revealed a specific loss of TARPγ-2, a key AMPA receptor trafficking protein. Expression of TARPγ-2 in vivo in hAPP transgenic mice led to a restoration of AMPA currents. This database of proteome alterations represents a unique resource for the identification of protein alterations responsible for AD. Highlights Proteomic analysis of mouse brains with AD-like pathology reveals stark remodeling Proteomic evidence points to a dysregulation of ApoE levels associated with Aβ clearance rather than production Co-expression analysis found distinctly impaired synapse and mitochondria modules In-depth analyses of AMPAR complex points to loss of TARPγ-2, which may compromise synapses in AD eTOC Blurb Proteome-wide profiling of brain tissue from three mouse models of AD-like pathology reveals Aβ, brain region, and age dependent alterations of protein levels. This resource provides a new global protein expression atlas for the Alzheimer’s disease research community.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».