MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2950158180 · doi:10.1097/01.hs9.0000563624.30413.c3

PS1336 DISCREPANCE OF ALLELIC BURDEN CHANGES AND CLINICAL RESPONSE IN PATIENTS WITH HIGHER RISK MYELODYSPLASTIC SYNDROME TREATED WITH HYPOMETHYLATING AGENTS

2019· article· en· W2950158180 sur OpenAlexaff
Joon Ho Moon, H.J. Cho, Dong Won Baek, Jae‐Sook Ahn, Seo Yeon Ahn, S.H. Choi, T. Kim, Z. Zhang, S.K. Sohn, D.D.H. Kim, H.‐J. Kim

Notice bibliographique

RevueHemaSphere · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDecitabineAzacitidineMedicineInternal medicineMyelodysplastic syndromesInternational Prognostic Scoring SystemHypomethylating agentAlleleGastroenterologyMyeloidOncologyBone marrowGeneGeneticsDNA methylationBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Hypomethylating agents (HMAs) such as azacitidine (AZA) and decitabine (DEC) are used to treat higher risk myelodysplastic syndrome (HR‐MDS). However, underlying genetics and allelic burden change after HMAs needs to be clarified. Aims: This study investigated the effects of alleleic burden changes on the clinical outcomes after treatment with HMAs. Methods: This study included bone marrow samples from 64 patients (34 AZA and 30 DEC) taken at diagnosis and follow‐up after median 4 cycles. Targeted deep sequencing on a custom myeloid gene panel of 84 genes (Agilent SureSelect) was performed on trios of T‐cell, pre‐HMA, and post‐HMA samples on 64 HR‐MDS patients. Results: At diagnosis, we detected 135 mutations from 54 patients. Most frequently mutated genes were TP53 (n = 9), DNMT3A (n = 7), ASXL1 (n = 7), DDX41 (n = 7) and U2AF1 (n = 6). HMAs were administered median 4 cycles (range 1–14). At follow‐up, allelic burdens were decreased from median 13.7% (range 1.5–87.7) to 1.7% (range 0.0–49.4%), where from median 9.9% to 0.8% in AZA group ( p < 0.001) and from median 17.8% to 6.7% in DEC group (p = 0.005). CR/mCR rate were higher in patients with allelic burden reduction <2% (n = 26/43, 60%) than those without (24%, n = 5/21), but not significantly different (p = 0.765). With median follow‐up duration of 19.3 months (range 0.2–99.6 months), 2‐year overall survival (OS) rates were 54.6 ± 8.1% and 44.8 ± 11.3% in patients with and without allelic burden reduction, respectively (p = 0.907). The presence of TP53 mutations did not affect the achievement of CR/mCR (p = 0.379). However, the presence of TP53 mutations were associated with inferior OS rates: 2‐year OS rates of 56.5 ± 7.2% and 22.2 ± 13.9% (p = 0.001). In the multivariate analysis, IPSS high (HR 5.34) and the presence of TP53 mutations (HR 3.42) affected adversely on OS, while the achievement of CR/mCR (HR 0.23) and the performance of allogeneic transplantation (HR 0.33) were favorable factors for OS. Summary/Conclusion: This study showed that allelic burden is decreased after treatment with both azacitidine and decitabine in HR‐MDS patients. However, the allelic burden reduction is independent to the achievement of CR and OS. The presence of TP53 mutation remained independent prognostic factor in HR‐MDS patients treated with HMAs, even with decreased allelic burden.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,652

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueHemaSphereMême sujetAcute Myeloid Leukemia ResearchTravaux en français237 207