Occurrence and geographic distribution of <i>Squash leaf curl virus</i> in the Baja California Peninsula, Mexico
Notice bibliographique
Résumé
Squash leaf curl (SLC) disease causes serious damage in a great diversity of horticultural crops worldwide and is due to infection by different ssDNA bipartite begomoviruses (Family Geminiviridae). Symptoms of leaf yellowing, stunting and curling have been observed in squash crops in the southern region of the Baja California (BC) Peninsula in the northwestern region of Mexico for at least a decade. The damage estimated for all localities showed disease incidence of 73.3% to 97.7% and severity of 49%. Infected plants were collected in three localities in addition to adult whiteflies for species determination. Squash leaf curl virus (SLCuV) was detected in both infected plants and whiteflies by PCR using specific primers that amplified a 601 bp fragment. The full-length DNA-A sequence was 99.1% identical to sequences in GenBank. Phylogenetic studies using the core CP region showed that the BC isolate grouped within a well-defined clade together with SLCuV from the Mediterranean Middle East and USA. The molecular analysis in individual adult whiteflies determined that all populations belonged to Bemisia tabaci (MEAM1) (biotype B) species. No evidence of the Mediterranean (MED) species (biotype Q) was found. The SLC disease has prevailed in squash in the region in several growing cycles and in geographically separated localities. To the best of our knowledge, this is the first report of SLCuV associated with squash plants in BCS, Mexico.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».