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Enregistrement W2950375827 · doi:10.1038/s41588-019-0397-8

Genome-wide association study identifies 30 loci associated with bipolar disorder

2019· review· en· W2950375827 sur OpenAlexafffund
Eli A. Stahl, Gerome Breen, Andreas J. Forstner, Andrew McQuillin, Stephan Ripke, Vassily Trubetskoy, Manuel Mattheisen, Yunpeng Wang, Jonathan R. I. Coleman, Héléna A. Gaspar, Christiaan de Leeuw, Stacy Steinberg, Jennifer M. Whitehead Pavlides, Maciej Trzaskowski, Enda M. Byrne, Tune H. Pers, Peter Holmans, Alexander Richards, Liam Abbott, Esben Agerbo, Huda Akil, Diego Albani, Ney Alliey‐Rodriguez, Thomas D. Als, Adebayo Anjorin, Verneri Antilla, Swapnil Awasthi, Judith A. Badner, Marie Bækvad‐Hansen, Jack D. Barchas, Nicholas Bass, Michael Bauer, Richard A. Belliveau, Sarah E. Bergen, Carsten Bøcker Pedersen, Erlend Bøen, Marco P. Boks, James Boocock, Monika Budde, William E. Bunney, Margit Burmeister, Jonas Bybjerg‐Grauholm, William Byerley, Miguel Casas, Felecia Cerrato, Pablo Cervantes, Kimberly Chambert, Alexander W. Charney, Danfeng Chen, Toni‐Kim Clarke, William Coryell, David W. Craig, Cristiana Cruceanu, David Curtis, Piotr M. Czerski, Anders M. Dale, Simone de Jong, Franziska Degenhardt, Jurgen Del‐Favero, J. Raymond DePaulo, Srdjan Djurovic, Amanda Dobbyn, Ashley Dumont, Torbjørn Elvsåshagen, Valentina Escott‐Price, Chun Chieh Fan, Sascha B. Fischer, Matthew Flickinger, Tatiana Foroud, Liz Forty, Josef Frank, Christine Fraser, Nelson B. Freimer, Louise Frisén, Katrin Gade, Diane Gage, Julie Garnham, Claudia Giambartolomei, Marianne Giørtz Pedersen, Jaqueline Goldstein, Scott D. Gordon, Katherine Gordon‐Smith, Elaine Green, Melissa J. Green, Tiffany A. Greenwood, Jakob Grove, Weihua Guan, José Guzmán‐Parra, Marian L. Hamshere, Martin Hautzinger, Urs Heilbronner, Stefan Herms, Maria Hipolito, Per Hoffmann, Dominic Holland, Laura M. Huckins, Stéphane Jamain, Jessica Johnson, Anders Juréus, Radhika Kandaswamy, Robert Karlsson, James L. Kennedy, Sarah Kittel‐Schneider, James A. Knowles, Manolis Kogevinas, Anna C. Koller, Ralph Kupka, Catharina Lavebratt, Jacob Lawrence, William Lawson, Markus Leber, Phil H. Lee, Shawn Levy, Jun Z. Li, Chunyu Liu, Susanne Lucae, Anna Maaser, Donald J. MacIntyre, Pamela B. Mahon, Wolfgang Maier, Lina Martinsson, Steve McCarroll, Peter McGuffin, Melvin G. McInnis, James McKay, Helena Medeiros, Sarah E. Medland, Fan Meng, Lili Milani, Grant W. Montgomery, Derek W. Morris, Thomas W. Mühleisen, Niamh Mullins, Hoang Nguyen, Caroline M. Nievergelt, Annelie Nordin Adolfsson, Evaristus Nwulia, Claire O’Donovan, Loes M. Olde Loohuis, Anil P. S. Ori, Lilijana Oruč, Urban Ösby, Roy H. Perlis, Amy Perry, Andrea Pfennig, James B. Potash, Shaun Purcell, Eline J. Regeer, Andreas Reif, Céline S. Reinbold, John P. Rice, Fabio Rivas, Margarita Rivera, Panos Roussos, Douglas M. Ruderfer, Euijung Ryu, Cristina Sánchez‐Mora, Alan F. Schatzberg, William A. Scheftner, Nicholas J. Schork, Cynthia Shannon Weickert, Tatyana Shehktman, Paul D. Shilling, Engilbert Sigurðsson, Claire Slaney, Olav B. Smeland, Janet L. Sobell, Christine Søholm Hansen, Anne T. Spijker, David St Clair, Michael Steffens, John S. Strauss, Fabian Streit, Jana Strohmaier, Szabolcs Szelinger, Robert C. Thompson, Thorgeir E. Thorgeirsson, Jens Treutlein, Helmut Vedder, Weiqing Wang, Stanley J. Watson, Thomas W. Weickert, Stephanie H. Witt, Simon Xi, Wei Xu, Allan H. Young, Peter P. Zandi, Peng Zhang, Sebastian Zöllner, Rolf Adolfsson, Ingrid Agartz, Martin Alda, Lena Backlund, Bernhard T. Baune, Frank Bellivier, Wade H. Berrettini, Joanna M. Biernacka, Douglas Blackwood, Michael Boehnke, Anders D. Børglum, Aiden Corvin, Nicholas Craddock, Mark J. Daly, Udo Dannlowski, Tõnu Esko, Bruno Étain, Mark A. Frye, Janice M. Fullerton, Elliot S. Gershon, Michael Gill, Fernando S. Goes, Maria Grigoroiu‐Serbânescu, Joanna Hauser, David M. Hougaard, Christina M. Hultman, Ian Jones, Lisa Jones, René S. Kahn, George Kirov, Mikael Landén, Marion Leboyer, Cathryn M. Lewis, Qingqin S. Li, Jolanta Lissowska, Nicholas G. Martin, Fermín Mayoral, Susan L. McElroy, Andrew M. McIntosh, Francis J. McMahon, Ingrid Melle, Andres Metspalu, Philip B. Mitchell, Gunnar Morken, Ole Mors, Preben Bo Mortensen, Bertram Müller‐Myhsok, R Myers, Benjamin M. Neale, Vishwajit L. Nimgaonkar, Merete Nordentoft, Markus M. Nöthen, Michael O‘Donovan, Ketil J. Øedegaard, Michael J. Owen, Sara A. Paciga, Carlos N. Pato, Michele T. Pato, Daniëlle Posthuma, Josep Antoni Ramos‐Quiroga, Marta Ribasés, Marcella Rietschel, Guy A. Rouleau, Martin Schalling, Peter R. Schofield, Thomas G. Schulze, Alessandro Serretti, Jordan W. Smoller, Hreinn Stefánsson, Kāri Stefánsson, Eystein Stordal, Patrick F. Sullivan, Gustavo Turecki, Eduard Vieta, John B. Vincent, Thomas Werge, John I. Nürnberger, Naomi R. Wray, Arianna Di Florio, Howard J. Edenberg, Sven Cichon, Roel A. Ophoff, Laura J. Scott, Ole A. Andreassen, John R. Kelsoe, Pamela Sklar

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2019
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill UniversityPublic Health OntarioMontreal Neurological Institute and HospitalDalhousie UniversityUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental HealthPrincess Margaret Cancer CentreMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilCenter for Individualized Medicine, Mayo ClinicH. Lundbeck A/SMedical Research CouncilVetenskapsrådetNSW Ministry of HealthRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnNational Institute of Mental HealthAarhus UniversitetStockholms Läns LandstingEli Lilly and CompanyLundbeckfondenSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungWorld Health OrganizationWellcome TrustAgence Nationale de la RechercheGeneralitat de CatalunyaNational Institute for Health and Care ResearchEuropean Regional Development FundCentro de Investigación Biomédica en Red de Salud MentalDeutsche ForschungsgemeinschaftPfizerCanadian Institutes of Health ResearchNational Science Foundation
Mots-clésBiologyGenome-wide association studyGeneticsBipolar disorderGenetic associationAssociation (psychology)GenomeComputational biologyEvolutionary biologySingle-nucleotide polymorphismGeneGenotypeNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bipolar disorder is a highly heritable psychiatric disorder. We performed a genome-wide association study (GWAS) including 20,352 cases and 31,358 controls of European descent, with follow-up analysis of 822 variants with P < 1 × 10−4 in an additional 9,412 cases and 137,760 controls. Eight of the 19 variants that were genome-wide significant (P < 5 × 10−8) in the discovery GWAS were not genome-wide significant in the combined analysis, consistent with small effect sizes and limited power but also with genetic heterogeneity. In the combined analysis, 30 loci were genome-wide significant, including 20 newly identified loci. The significant loci contain genes encoding ion channels, neurotransmitter transporters and synaptic components. Pathway analysis revealed nine significantly enriched gene sets, including regulation of insulin secretion and endocannabinoid signaling. Bipolar I disorder is strongly genetically correlated with schizophrenia, driven by psychosis, whereas bipolar II disorder is more strongly correlated with major depressive disorder. These findings address key clinical questions and provide potential biological mechanisms for bipolar disorder. Genome-wide analysis identifies 30 loci associated with bipolar disorder, allowing for comparisons of shared genes and pathways with other psychiatric disorders, including schizophrenia and depression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 627
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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