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Enregistrement W2950458829 · doi:10.1101/126631

Environmental cystine drives glutamine anaplerosis and sensitizes cells to glutaminase inhibition

2017· preprint· en· W2950458829 sur OpenAlexfundno aff
Alexander Muir, Laura V. Danai, Dan Y. Gui, Chiara Y Waingarten, Matthew G. Vander Heiden

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Center for Advancing Translational SciencesYork UniversityAustralian Government
Mots-clésGlutamineGlutaminaseCatabolismBiochemistryBiologyCystineMetabolismCell biologyAmino acidEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Many cancer cell lines depend on extracellular glutamine as a major tri-carboxylic acid (TCA) cycle anaplerotic substrate to support proliferation in vitro . However, recent studies have suggested that some cells that depend on glutamine anaplerosis in culture rely much less on glutamine catabolism to proliferate in vivo , with environmental differences between tumors and cell culture influencing the extent of glutamine catabolism. Here we sought to better understand the environmental differences that cause differential dependence on glutamine for TCA cycle anaplerosis. We find that cells cultured in adult bovine serum, a condition that more closely reflects the nutrients available to cells in vivo , leads to decreased glutamine catabolism and reliance on glutamine anaplerosis compared to standard tissue culture conditions. By analyzing the nutrient differences between bovine serum and media, we find that levels of a single nutrient, cystine, can account for the differential dependence on glutamine in these different environmental contexts. Further, we show that cystine levels dictate glutamine dependence via the cystine/glutamate antiporter xCT/ SLC7A11 , and that environmental cystine levels in conjunction with xCT/SLC7A11 expression is necessary and sufficient to drive increased glutamine anaplerosis, defining important determinants of glutamine anaplerosis and glutaminase dependence in cancer cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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