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Enregistrement W2950558056 · doi:10.1186/s12862-017-0965-4

The impact of migratory flyways on the spread of avian influenza virus in North America

2017· article· en· W2950558056 sur OpenAlex
Mathieu Fourment, Aaron E. Darling, Edward C. Holmes

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueBMC Evolutionary Biology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilAustralian Research CouncilMedical Research Council
Mots-clésBiological dispersalBiologyPhylogeographyEvolutionary biologyAvian influenza virusRange (aeronautics)Bird migrationEcologyTransmission (telecommunications)Influenza A virus subtype H5N1GeographyPhylogenetic treeVirusPopulationVirologyGeneDemographyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Wild birds are the major reservoir hosts for influenza A viruses (AIVs) and have been implicated in the emergence of pandemic events in livestock and human populations. Understanding how AIVs spread within and across continents is therefore critical to the development of successful strategies to manage and reduce the impact of influenza outbreaks. In North America many bird species undergo seasonal migratory movements along a North-South axis, thereby providing opportunities for viruses to spread over long distances. However, the role played by such avian flyways in shaping the genetic structure of AIV populations remains uncertain. RESULTS: To assess the relative contribution of bird migration along flyways to the genetic structure of AIV we performed a large-scale phylogeographic study of viruses sampled in the USA and Canada, involving the analysis of 3805 to 4505 sequences from 36 to 38 geographic localities depending on the gene segment data set. To assist in this we developed a maximum likelihood-based genetic algorithm to explore a wide range of complex spatial models, depicting a more complete picture of the migration network than determined previously. CONCLUSIONS: Based on phylogenies estimated from nucleotide sequence data sets, our results show that AIV migration rates are significantly higher within than between flyways, indicating that the migratory patterns of birds play a key role in viral dispersal. These findings provide valuable insights into the evolution, maintenance and transmission of AIVs, in turn allowing the development of improved programs for surveillance and risk assessment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,744

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,097
Tête enseignante GPT0,402
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle